Dr. Öğr. Üyesi UMUT İNCİ ONAT


Mühendislik ve Doğa Bilimleri Fakültesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü


WoS Araştırma Alanları: Doğa Bilimleri Genel, Biyoloji Ve Biyokimya, Moleküler Biyoloji Ve Genetik


Scopus Araştırma Alanları: Biyokimya (tıbbi), Moleküler Biyoloji


Avesis Araştırma Alanları: Metabolizma, Hayvan Patolojisi, Genetik Bozuklukların Moleküler Biyolojisi, Hayvan Moleküler Genetiği, Temel Bilimler


Yayınlardaki İsimler: Şimşek. İ, Onat Umut Inci, Onat U I, Onat U. I., Onat Umut I., Umut Inci Onat, Onat Umut I

Metrikler

Yayın

20

Yayın (WoS)

13

Yayın (Scopus)

9

Atıf (WoS)

376

H-İndeks (WoS)

6

Atıf (Scopus)

394

H-İndeks (Scopus)

6

Atıf (Scholar)

536

H-İndeks (Scholar)

6

Atıf (TrDizin)

4

H-İndeks (TrDizin)

1

Proje

3

Tez Danışmanlığı

1

Açık Erişim

1

Biyografi

Dr. Umut Inci Onat was graduated from Bilkent University with a BS degree in Molecular Biology and Genetics and pursued her PhD degree in Molecular Biology and Genetics in Bilkent University under supervision of Assoc.Prof. Ebru Erbay. After completion of her PhD studies, she continued on her research as a post-doctoral fellow at UNAM in Bilkent University based on initiated work during her PhD. She then moved to Acibadem University as a post-doctoral researcher for one year and in the meantime she also did lecturing. She continues her research as Assistant Professor since October 2022.  She recently focused on understanding how inter-organelle stress communication between the ER, mitochondria and nucleus heightens inflammation during hyperlipidemia, as well as how this communication affects well-known regulatory pathways in atherosclerosis progression such as efferocytosis, apoptosis and cholesterol metabolism; and to leverage this knowledge to design molecular intervention studies that can be further developed into novel therapeutics for cardiometabolic diseases. In addition to those, she also focus on the interaction between these two high importance organelle and their immune-metabolic reflections in molecular pathway level, which are very important in other metabolic diseases as well as known genetic diseases, which cause malfunction in immunometabolism such as MS.

Eğitim Bilgileri

2012 - 2019

2012 - 2019

Bütünleşik Doktora

İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi, Mühendislik Ve Fen Bilimleri Enstitüsü, Moleküler Biyoloji ve Genetik, Türkiye

2008 - 2012

2008 - 2012

Lisans

İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi, Fen Fakültesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik, Türkiye

Yaptığı Tezler

2019

2019

Doktora

Entegre stres tepkisinin metaflamasyon ve atherosklerozdaki rolü

İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi, Mühendislik Ve Fen Bilimleri Enstitüsü, Moleküler Biyoloji ve Genetik

Yabancı Diller

C2 Ustalık

C2 Ustalık

İngilizce

Araştırma Alanları

Avesis Araştırma Alanları: Metabolizma, Hayvan Patolojisi, Genetik Bozuklukların Moleküler Biyolojisi, Hayvan Moleküler Genetiği, Temel Bilimler
WoS Araştırma Alanları: Doğa Bilimleri Genel, Biyoloji Ve Biyokimya, Moleküler Biyoloji Ve Genetik
Scopus Araştırma Alanları: Biyokimya (tıbbi), Moleküler Biyoloji

Akademik Faaliyetlere Dayalı Araştırma Alanları

Avesis Araştırma Alanları

    WoS Araştırma Alanları

      Scopus Araştırma Alanları

        Akademik Ünvanlar / Görevler

        2022 - Devam Ediyor

        2022 - Devam Ediyor

        Dr. Öğr. Üyesi

        Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi, Mühendislik Ve Doğa Bilimleri Fakültesi, Moleküler Biyoloji Ve Genetik Bölümü

        2019 - 2021

        2019 - 2021

        Araştırmacı

        İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

        2012 - 2019

        2012 - 2019

        Uzmanlık Öğrencisi

        İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Moleküler Biyoloji ve Genetik

        Yönetimsel Görevler

        2026 - Devam Ediyor

        2026 - Devam Ediyor

        Uygulama ve Araştırma Merkezi Müdür Yardımcısı

        Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi, Genel Sekreter, Deney Hayvanları Uygulama ve Araştırma Merkezi (DEHAM)

        2024 - Devam Ediyor

        2024 - Devam Ediyor

        Fakülte Kurulu Üyesi

        Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi, Mühendislik Ve Doğa Bilimleri Fakültesi, Moleküler Biyoloji Ve Genetik Bölümü

        2024 - Devam Ediyor

        2024 - Devam Ediyor

        Staj Başkanı

        Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi, Mühendislik Ve Doğa Bilimleri Fakültesi, Moleküler Biyoloji Ve Genetik Bölümü

        2024 - Devam Ediyor

        2024 - Devam Ediyor

        Bölüm FEDEK Komisyonu Üyesi

        Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi, Mühendislik Ve Doğa Bilimleri Fakültesi, Moleküler Biyoloji Ve Genetik Bölümü

        2025 - 2026

        2025 - 2026

        Deney Hayvanları Etik Kurulu Üyesi

        Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi, Mühendislik Ve Doğa Bilimleri Fakültesi, Moleküler Biyoloji Ve Genetik Bölümü

        Verdiği Dersler

        Doktora

        Doktora

        Moleküler Biyoloji ve Genetikte İleri Araştırma Teknikleri ve Etik

        Yüksek Lisans

        Yüksek Lisans

        Moleküler Biyoloji ve Genetikte Araştırma Yöntemleri ve Etik

        Moleküler ve Transasyonel Biyotıp

        Moleküler ve Translasyonel Biyotıbba Giriş

        Lisans

        Lisans

        BiyoEtik

        Bitirme Projesi II

        Seminer

        Moleküler Genetik

        Biyokimya ve Genetik Araştırma Teknikleri II

        Biyokimya ve Genetik Araştırma Teknikleri I

        Yaz Araştırması

        İnsan Patolojisinde Hayvan Modelleri

        Bitirme Projesi I

        Genel Biyoloji II

        Oryantasyon

        Genel Biyoloji 1

        Biyokimya ve Genetik Araştırma Teknikleri II

        İnsan Patolojisinde Hayvan Modelleri

        Biyokimya ve Araştırma Teknikleri I

        Makaleler

        Tümü (9)
        SCI-E, SSCI, AHCI (9)
        SCI-E, SSCI, AHCI, ESCI (9)
        Scopus (9)

        Hakemli Bilimsel Toplantılarda Yayımlanmış Bildiriler

        2025

        2025

        2. Impact of LAMA5 Variants on Immune Cell Infiltration using 2D Blood Brain Barrier Culture Model of Multiple Sclerosis

        Voyvoda U., Karisik S. N., Reda M. D., Efe H., Cotuk ., Cakici B., et al.

        6th International Molecular Immunology and Immunogenetics Congress (MIMIC-VI), İstanbul, Türkiye, 28 - 30 Nisan 2025, ss.1-2, (Özet Bildiri)

        2023

        2023

        5. Hyperlipidemia affects synaptic integrity in the hippocampus but not cerebral cortex

        Şeker B., Kızıldağ F., Mengi Çamur N., Onat U. İ., Erbay E., Yanık T., et al.

        36 th ECNP Congress, Barcelona, İspanya, 07 Ekim 2023 - 10 Nisan 2024, cilt.2, sa.813, ss.81, (Özet Bildiri) Creative Commons License

        2023

        2023

        6. Identification of a splice variant in PSMB10 gene in a multiply affected family with undiagnosed autoinflammatory syndrome

        Gecgel M., Bulbul A. A., Sigli D., ONAT U. İ., Ugurlu S., Tahir Turanlı E.

        56th Annual Conference of the European-Society-of-Human-Genetics (ESHG), Glasgow, İngiltere, 10 - 13 Haziran 2023, cilt.32, ss.175, (Özet Bildiri) identifier

        2023

        2023

        8. Identification of a splice variant in PSMB10 gene in a multiply affected family with undiagnosed autoinflammatory syndrome.”

        Tahir Turanlı E., Geçgel M., Onat U. İ., Uğurlu S., Bülbül A., Siğli D.

        European Society of Human Genetics conference (ESHG 2023), Glasgow, İngiltere, 10 - 13 Haziran 2023, ss.1, (Özet Bildiri)

        2016

        2016

        9. Nutritional modification of endoplasmic reticulum stress and inflammasome activity by a bioactive lipokine prevents atherosclerosis

        Kocaturk B., Cimen I., Tufanli O., Koyuncu S., Apaydin O., Onat U. İ., et al.

        41st FEBS Congress on Molecular and Systems Biology for a Better Life, Kusadasi, Türkiye, 3 - 08 Eylül 2016, cilt.283, ss.25, (Özet Bildiri) identifier

        2014

        2014

        10. Characterization of PERK-directed endoplasmic reticulum stress response to lipids

        Onat U. İ., Koyuncu S., Demirsoy S., Erbay E.

        FEBS EMBO 2014 Conference, Paris, Fransa, 30 Ağustos - 04 Eylül 2014, cilt.281, ss.106, (Özet Bildiri) identifier

        2014

        2014

        11. The role of macrophage inositol requiring enzyme-1 in lipid-induced inflammation

        Tufanli O., Simsek I., Koyuncu S., Erbay E.

        FEBS EMBO 2014 Conference, Paris, Fransa, 30 Ağustos - 04 Eylül 2014, cilt.281, ss.181, (Özet Bildiri) identifier

        Desteklenen Projeler

        2023 - 2026

        2023 - 2026

        Investigation of functional roles of LAMA5 gene variants identified in a cohort of Turkish multiple sclerosis families on the disease pathophysiology

        TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı

        Tahir Turanlı E. (Yürütücü), Onat U. İ., Timuçin A. C.

        2022 - 2026

        2022 - 2026

        Ateroskleroza Karşi Fagositoz Tetikleyici Kimerik Proteinler

        TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı

        (Proje Özeti)
        Onat U. İ., Öztürk M.(Yürütücü)

        Bilimsel Kuruluşlardaki Üyelikler / Görevler

        2014 - Devam Ediyor

        2014 - Devam Ediyor

        Moleküler Biyoloji Derneği

        Üye

        Bilimsel Projelerde Hakemlikler

        Temmuz 2025

        Temmuz 2025

        TÜBİTAK Projesi

        1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı, Acibadem Üniversites, Türkiye

        Mayıs 2025

        Mayıs 2025

        TÜBİTAK Projesi

        2237 - Proje Eğitimi Etkinliklerini Destekleme Programı, Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi, Türkiye

        Etkinlik Organizasyonlarındaki Görevler

        Mayıs 2025

        Mayıs 2025

        Mezuniyet Projeleri Fuarı

        Öğrenci Kulübü ve Toplulukları Faaliyeti

        Onat U. İ., Kırımlı E. E., Akyıldız E. O.
        İstanbul, Türkiye

        Şubat 2024

        Şubat 2024

        Lise Moleküler Biyoloji Genetik Kış Kampı

        Bilim / Sanat Kampı veya Yaz Okulu Organizasyonu

        Tokcaer Keskin Z., Süer E., Onat U. İ.
        Türkiye

        Ödüller

        Ekim 2019

        Ekim 2019

        Yılın Doktora Başarı Ödülü -2019

        Moleküler Biyoloji Derneği

        

        Kongre ve Sempozyum Katılımı Faaliyetleri

        28 Nisan 2025 - 30 Nisan 2025

        28 Nisan 2025 - 30 Nisan 2025

        6. Uluslararası İmmünoloji ve İmmünogenetik Kongresi MIMIC6

        Katılımcı

        İstanbul-Türkiye

        30 Ekim 2024 - 01 Kasım 2024

        30 Ekim 2024 - 01 Kasım 2024

        LEPTIN and METABOLISM

        İzleyici / Dinleyici

        İstanbul-Türkiye

        11 Mayıs 2024 - 12 Mayıs 2024

        11 Mayıs 2024 - 12 Mayıs 2024

        Acugen Life Science Sempozyumu

        İzleyici / Dinleyici

        İstanbul-Türkiye

        09 Haziran 2022 - 12 Haziran 2022

        09 Haziran 2022 - 12 Haziran 2022

        Molbiyokon 8

        Katılımcı

        İstanbul-Türkiye

        27 Eylül 2019 - 29 Eylül 2019

        27 Eylül 2019 - 29 Eylül 2019

        Molbiyokon 7

        Davetli Konuşmacı

        İstanbul-Türkiye

        Davetli Konuşmalar

        Ekim 2019

        Ekim 2019

        3rd COST Action CardioRNA Working Group Meeting

        Çalıştay

        COST- EU-Belçika

        Eylül 2019

        Eylül 2019

        7th International Congress of Molecular Biology Association

        Konferans

        Moleküler Biyoloji Derneği-Türkiye

        Atıflar

        Toplam Atıf Sayısı (SCOPUS): 394

        h-indeksi (SCOPUS): 6

        Jüri Üyelikleri

        Aralık-2025

        Aralık 2025

        Doktora Yeterlik Sınavı

        Sümeyye Cilmeli Doktora Yeterlik Sınavı - Bezmiâlem Vakıf Üniversitesi

        Ağustos-2024

        Ağustos 2024

        Tez Savunma (Doktora)

        Aliye Bulut Doktora Tez Savunması Jüri Üyesi - Boğaziçi Üniversitesi