Metrikler
Biyografi
Dr. Umut Inci Onat was graduated from Bilkent University with a BS degree in Molecular Biology and Genetics and pursued her PhD degree in Molecular Biology and Genetics in Bilkent University under supervision of Assoc.Prof. Ebru Erbay. After completion of her PhD studies, she continued on her research as a post-doctoral fellow at UNAM in Bilkent University based on initiated work during her PhD. She then moved to Acibadem University as a post-doctoral researcher for one year and in the meantime she also did lecturing. She continues her research as Assistant Professor since October 2022. She recently focused on understanding how inter-organelle stress communication between the ER, mitochondria and nucleus heightens inflammation during hyperlipidemia, as well as how this communication affects well-known regulatory pathways in atherosclerosis progression such as efferocytosis, apoptosis and cholesterol metabolism; and to leverage this knowledge to design molecular intervention studies that can be further developed into novel therapeutics for cardiometabolic diseases. In addition to those, she also focus on the interaction between these two high importance organelle and their immune-metabolic reflections in molecular pathway level, which are very important in other metabolic diseases as well as known genetic diseases, which cause malfunction in immunometabolism such as MS.
Eğitim Bilgileri
2012 - 2019
2012 - 2019Bütünleşik Doktora
İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi, Mühendislik Ve Fen Bilimleri Enstitüsü, Moleküler Biyoloji ve Genetik, Türkiye
2008 - 2012
2008 - 2012Lisans
İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi, Fen Fakültesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik, Türkiye
Yaptığı Tezler
2019
2019Doktora
Entegre stres tepkisinin metaflamasyon ve atherosklerozdaki rolü
İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi, Mühendislik Ve Fen Bilimleri Enstitüsü, Moleküler Biyoloji ve Genetik
Yabancı Diller
C2 Ustalık
C2 Ustalıkİngilizce
Araştırma Alanları
Akademik Faaliyetlere Dayalı Araştırma Alanları
Avesis Araştırma Alanları
WoS Araştırma Alanları
Scopus Araştırma Alanları
Akademik Ünvanlar / Görevler
2022 - Devam Ediyor
2022 - Devam EdiyorDr. Öğr. Üyesi
Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi, Mühendislik Ve Doğa Bilimleri Fakültesi, Moleküler Biyoloji Ve Genetik Bölümü
2019 - 2021
2019 - 2021Araştırmacı
İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi
2012 - 2019
2012 - 2019Uzmanlık Öğrencisi
İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Moleküler Biyoloji ve Genetik
Yönetimsel Görevler
2026 - Devam Ediyor
2026 - Devam EdiyorUygulama ve Araştırma Merkezi Müdür Yardımcısı
Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi, Genel Sekreter, Deney Hayvanları Uygulama ve Araştırma Merkezi (DEHAM)
2024 - Devam Ediyor
2024 - Devam EdiyorFakülte Kurulu Üyesi
Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi, Mühendislik Ve Doğa Bilimleri Fakültesi, Moleküler Biyoloji Ve Genetik Bölümü
2024 - Devam Ediyor
2024 - Devam EdiyorStaj Başkanı
Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi, Mühendislik Ve Doğa Bilimleri Fakültesi, Moleküler Biyoloji Ve Genetik Bölümü
2024 - Devam Ediyor
2024 - Devam EdiyorBölüm FEDEK Komisyonu Üyesi
Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi, Mühendislik Ve Doğa Bilimleri Fakültesi, Moleküler Biyoloji Ve Genetik Bölümü
2025 - 2026
2025 - 2026Deney Hayvanları Etik Kurulu Üyesi
Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi, Mühendislik Ve Doğa Bilimleri Fakültesi, Moleküler Biyoloji Ve Genetik Bölümü
Verdiği Dersler
Yüksek Lisans
Moleküler Biyoloji ve Genetikte Araştırma Yöntemleri ve Etik
Moleküler ve Transasyonel Biyotıp
Moleküler ve Translasyonel Biyotıbba Giriş
Lisans
BiyoEtik
Bitirme Projesi II
Seminer
Moleküler Genetik
Biyokimya ve Genetik Araştırma Teknikleri II
Biyokimya ve Genetik Araştırma Teknikleri I
Yaz Araştırması
İnsan Patolojisinde Hayvan Modelleri
Bitirme Projesi I
Genel Biyoloji II
Oryantasyon
Genel Biyoloji 1
Biyokimya ve Genetik Araştırma Teknikleri II
İnsan Patolojisinde Hayvan Modelleri
Biyokimya ve Araştırma Teknikleri I
Makaleler
2025
20251. Molecular Consequences of CCN6 Variants Encoding WISP3 in Progressive Pseudorheumatoid Dysplasia
Guven Tasbicen G., Tufan A., Savsar B., Bulbul A. A., Tonbul Z., Guzel E., et al.
INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES , cilt.26, ss.1-33, 2025 (SCI-Expanded, Scopus)
2024
20242. A rare case of uncharacterized autoinflammatory disease: Patient carrying variations in NLRP3 and TNFRSF1A genes.
Kilinc O. C., Gayibova K., Onen M. O., Onat U. I., Bülbül A. A., Timucin A. C., et al.
American journal of medical genetics. Part A
, cilt.194, sa.10, 2024 (SCI-Expanded, Scopus)
2023
20233. Detection of a rare variant in PSTPIP1 through three generations in a family with an initial diagnosis of FMF/MKD-overlapping phenotype
Özkılınç Önen M., Onat U. İ., Uğurlu S., Timuçin A. C., Öz Arslan D., Everest E., et al.
RHEUMATOLOGY
, sa.9, ss.3188-3196, 2023 (SCI-Expanded, Scopus)
2023
20234. Prospective outcome analysis of multiple sclerosis cases reveals candidate prognostic cerebrospinal fluid markers.
Everest E., Uygunoglu U., Tutuncu M., Bulbul A. A., Onat U. İ., Unal M., et al.
PloS one
, cilt.18, sa.6, 2023 (SCI-Expanded, Scopus)
2020
20205. Inositol-requiring enzyme-1 regulates phosphoinositide signaling lipids and macrophage growth
Hamid S. M., Citir M., Terzi E. M., Cimen I., Yildirim Z., Dogan A. E., et al.
EMBO REPORTS
, cilt.21, sa.12, 2020 (SCI-Expanded, Scopus)
2019
20196. Double bond configuration of palmitoleate is critical for atheroprotection
Cimen I., Yildirim Z., Dogan A. E., Yildirim A. D., Tufanli O., Onat U. İ., et al.
MOLECULAR METABOLISM
, cilt.28, ss.58-72, 2019 (SCI-Expanded, Scopus)
2019
20197. Intercepting the Lipid-Induced Integrated Stress Response Reduces Atherosclerosis
Onat U. İ., Yildirim A. D., Tufanli O., Cimen I., Kocatürk B., Veli Z., et al.
JOURNAL OF THE AMERICAN COLLEGE OF CARDIOLOGY
, cilt.73, sa.10, ss.1149-1169, 2019 (SCI-Expanded, Scopus)
2017
20178. Targeting IRE1 with small molecules counteracts progression of atherosclerosis
Tufanli O., Akillilar P. T., Acosta-Alvear D., Kocatürk B., Onat U. İ., Hamid S. M., et al.
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
, cilt.114, sa.8, 2017 (SCI-Expanded, Scopus)
2016
20169. Prevention of atherosclerosis by bioactive palmitoleate through suppression of organelle stress and inflammasome activation
Cimen I., Kocatürk B., Koyuncu S., Tufanli O., Onat U. İ., Yildirim A. D., et al.
SCIENCE TRANSLATIONAL MEDICINE
, cilt.8, sa.358, 2016 (SCI-Expanded, Scopus)
Hakemli Bilimsel Toplantılarda Yayımlanmış Bildiriler
2025
20251. Analysis of the Interaction Between PTP-PEST and PSTPIP1 in an In Vitro Cell Culture Model
Tonbul Z., Tahir Turanlı E., Onat U. İ.
MIMIC-VI, İstanbul, Türkiye, 28 - 30 Nisan 2025, ss.99, (Özet Bildiri)
2025
20252. Impact of LAMA5 Variants on Immune Cell Infiltration using 2D Blood Brain Barrier Culture Model of Multiple Sclerosis
Voyvoda U., Karisik S. N., Reda M. D., Efe H., Cotuk ., Cakici B., et al.
6th International Molecular Immunology and Immunogenetics Congress (MIMIC-VI), İstanbul, Türkiye, 28 - 30 Nisan 2025, ss.1-2, (Özet Bildiri)
2024
20243. Unveiling the Role of PSMB10 Gene Splice Variant in Dominantly Inherited Auto- inflammatory Disease: Insights into Autophagy Interaction and Clinical Im
Savsar B., Tonbul Z., Onat U. İ., Sever E., Uğurlu S., Öz Arslan D., et al.
Molbiyokon24, İzmir, Türkiye, 12 - 14 Eylül 2024, ss.241, (Özet Bildiri)
2024
20244. A rare case of uncharacterised autoinflammatory disease: patient carrying variations in NLRP3 and TNFRSF1A genes
Kılınç Ö. C., Gayibova K., Durucan İ., Özkılınç Önen M., Onat U. İ., Bülbül A., et al.
European Congress of Rheumatology, Vienna, Avusturya, 12 - 15 Haziran 2024, (Yayınlanmadı)
2023
20235. Hyperlipidemia affects synaptic integrity in the hippocampus but not cerebral cortex
Şeker B., Kızıldağ F., Mengi Çamur N., Onat U. İ., Erbay E., Yanık T., et al.
36 th ECNP Congress, Barcelona, İspanya, 07 Ekim 2023 - 10 Nisan 2024, cilt.2, sa.813, ss.81, (Özet Bildiri)
2023
20236. Identification of a splice variant in PSMB10 gene in a multiply affected family with undiagnosed autoinflammatory syndrome
Gecgel M., Bulbul A. A., Sigli D., ONAT U. İ., Ugurlu S., Tahir Turanlı E.
56th Annual Conference of the European-Society-of-Human-Genetics (ESHG), Glasgow, İngiltere, 10 - 13 Haziran 2023, cilt.32, ss.175, (Özet Bildiri)
2023
20237. PPP1R32 PROTEİN VARYANTININ İNFLAMAZOM AKTİVİTESİNİN İN VİTRO HÜCRE KÜLTÜRÜ MODELİNDE ARAŞTIRILMASI
Tahir Turanlı E., Tonbul Z., Onat U. İ., Kasapçopur Ö.
XXVI ULUSAL İMMÜNOLOJİ KONGRESİ, Ankara, Türkiye, 11 - 13 Kasım 2023, ss.94, (Özet Bildiri)
2023
20238. Identification of a splice variant in PSMB10 gene in a multiply affected family with undiagnosed autoinflammatory syndrome.”
Tahir Turanlı E., Geçgel M., Onat U. İ., Uğurlu S., Bülbül A., Siğli D.
European Society of Human Genetics conference (ESHG 2023), Glasgow, İngiltere, 10 - 13 Haziran 2023, ss.1, (Özet Bildiri)
2016
20169. Nutritional modification of endoplasmic reticulum stress and inflammasome activity by a bioactive lipokine prevents atherosclerosis
Kocaturk B., Cimen I., Tufanli O., Koyuncu S., Apaydin O., Onat U. İ., et al.
41st FEBS Congress on Molecular and Systems Biology for a Better Life, Kusadasi, Türkiye, 3 - 08 Eylül 2016, cilt.283, ss.25, (Özet Bildiri)
2014
201410. Characterization of PERK-directed endoplasmic reticulum stress response to lipids
Onat U. İ., Koyuncu S., Demirsoy S., Erbay E.
FEBS EMBO 2014 Conference, Paris, Fransa, 30 Ağustos - 04 Eylül 2014, cilt.281, ss.106, (Özet Bildiri)
2014
201411. The role of macrophage inositol requiring enzyme-1 in lipid-induced inflammation
Tufanli O., Simsek I., Koyuncu S., Erbay E.
FEBS EMBO 2014 Conference, Paris, Fransa, 30 Ağustos - 04 Eylül 2014, cilt.281, ss.181, (Özet Bildiri)
Desteklenen Projeler
2023 - 2026
2023 - 2026Investigation of functional roles of LAMA5 gene variants identified in a cohort of Turkish multiple sclerosis families on the disease pathophysiology
TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı
Tahir Turanlı E. (Yürütücü), Onat U. İ., Timuçin A. C.
2022 - 2026
2022 - 2026Ateroskleroza Karşi Fagositoz Tetikleyici Kimerik Proteinler
TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı
(Proje Özeti)
Onat U. İ., Öztürk M.(Yürütücü)
2022 - 2024
2022 - 2024Pyrin İnflamazomunda PSTPIP1 Proteini Varyantlarının In Vitro Hücre Kültürü Modelinde Araştırılması
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi
(Proje Özeti)
Onat U. İ., Coşkun F., Tahir Turanlı E. (Yürütücü)
Bilimsel Kuruluşlardaki Üyelikler / Görevler
2014 - Devam Ediyor
2014 - Devam EdiyorMoleküler Biyoloji Derneği
Üye
Bilimsel Projelerde Hakemlikler
Temmuz 2025
Temmuz 2025TÜBİTAK Projesi
1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı, Acibadem Üniversites, Türkiye
Mayıs 2025
Mayıs 2025TÜBİTAK Projesi
2237 - Proje Eğitimi Etkinliklerini Destekleme Programı, Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi, Türkiye
Etkinlik Organizasyonlarındaki Görevler
Mayıs 2025
Mayıs 2025Mezuniyet Projeleri Fuarı
Öğrenci Kulübü ve Toplulukları Faaliyeti
Onat U. İ., Kırımlı E. E., Akyıldız E. O.
İstanbul, Türkiye
Şubat 2024
Şubat 2024Lise Moleküler Biyoloji Genetik Kış Kampı
Bilim / Sanat Kampı veya Yaz Okulu Organizasyonu
Tokcaer Keskin Z., Süer E., Onat U. İ.
Türkiye
Haziran 2022
Haziran 20228th International Congress of the Molecular Biology of Turkey
Bilimsel Kongre / Sempozyum Organizasyonu
Tahir Turanlı E., Keskin Toklu N., Tokcaer Keskin Z., Bozaykut Eker P., Timuçin A. C., Onat U. İ.
Türkiye
Ödüller
Kongre ve Sempozyum Katılımı Faaliyetleri
28 Nisan 2025 - 30 Nisan 2025
28 Nisan 2025 - 30 Nisan 20256. Uluslararası İmmünoloji ve İmmünogenetik Kongresi MIMIC6
Katılımcı
İstanbul-Türkiye
30 Ekim 2024 - 01 Kasım 2024
30 Ekim 2024 - 01 Kasım 2024LEPTIN and METABOLISM
İzleyici / Dinleyici
İstanbul-Türkiye
11 Mayıs 2024 - 12 Mayıs 2024
11 Mayıs 2024 - 12 Mayıs 2024Acugen Life Science Sempozyumu
İzleyici / Dinleyici
İstanbul-Türkiye
09 Haziran 2022 - 12 Haziran 2022
09 Haziran 2022 - 12 Haziran 2022Molbiyokon 8
Katılımcı
İstanbul-Türkiye
27 Eylül 2019 - 29 Eylül 2019
27 Eylül 2019 - 29 Eylül 2019Molbiyokon 7
Davetli Konuşmacı
İstanbul-Türkiye
Davetli Konuşmalar
Ekim 2019
Ekim 20193rd COST Action CardioRNA Working Group Meeting
Çalıştay
COST- EU-Belçika
Eylül 2019
Eylül 20197th International Congress of Molecular Biology Association
Konferans
Moleküler Biyoloji Derneği-Türkiye
Atıflar
Toplam Atıf Sayısı (SCOPUS): 394
h-indeksi (SCOPUS): 6
Jüri Üyelikleri
Aralık-2025
Aralık 2025Doktora Yeterlik Sınavı
Sümeyye Cilmeli Doktora Yeterlik Sınavı - Bezmiâlem Vakıf Üniversitesi
Ağustos-2024
Ağustos 2024