Yayınlar & Eserler

Yayın Ağı
SCI, SSCI ve AHCI İndekslerine Giren Dergilerde Yayınlanan Makaleler

Residue-specific pathways in peptide fragmentation: The role of aromatic side chain in a3 ion formation from b3 ion

Atik A. E., Karaca S., Yalcin T.
International Journal of Mass Spectrometry , cilt.513, 2025 (SCI-Expanded) identifier

Peptide-Based Regulation of TNF-α-Mediated Cytotoxicity

Temur B. Z., Timuçin A. C., Atik A. E., Kocagöz Z. T., Can Ö.
BIOMOLECULES , cilt.15, sa.4, ss.559-578, 2025 (SCI-Expanded)

Comparative Forced Degradation Study of Anticomplement C5 Biosimilar and Originator Monoclonal Antibodies

Yamaci M. C., Pamukcu C., Erdemgil Y., Atik A. E., Keles Z. Z. Y., Can O.
PHARMACEUTICALS , cilt.18, sa.4, ss.1-18, 2025 (SCI-Expanded)

Protease-Resistant, Broad-Spectrum Antimicrobial Peptides with High Antibacterial and Antifungal Activity

Kocagoz T., Temur B. Z., Unubol N., Elmas M., Kanlidere Z., Cilingir S., et al.
LIFE-BASEL , cilt.15, sa.2, 2025 (SCI-Expanded) identifier identifier identifier

Gas-phase fragmentation reactions of a(7) ions containing a glutamine residue

ATİK A. E., Arslanoglu A., Yalcin T.
JOURNAL OF MASS SPECTROMETRY , cilt.56, sa.8, 2021 (SCI-Expanded) identifier identifier identifier

Observation of the side chain 0-methylation of glutamic acid or aspartic acid containing model peptides by electrospray ionization-mass spectrometry

Atik A. E., Guray M. Z., Yalcin T.
JOURNAL OF CHROMATOGRAPHY B-ANALYTICAL TECHNOLOGIES IN THE BIOMEDICAL AND LIFE SCIENCES , cilt.1047, ss.75-83, 2017 (SCI-Expanded) Creative Commons License identifier identifier identifier

Gas-phase structures and proton affinities of N-terminal proline containing b(2)(+) ions from protonated model peptides

Karaca S., Atik A. E., Elmaci N., Yalcin T.
INTERNATIONAL JOURNAL OF MASS SPECTROMETRY , cilt.393, ss.1-8, 2015 (SCI-Expanded) Creative Commons License identifier identifier

Specific rearrangement reactions of acetylated lysine containing peptide b(n) (n=4-7) ion series

Atik A. E., Hernandez O., Maitre P., Yalcin T.
JOURNAL OF MASS SPECTROMETRY , cilt.49, sa.12, ss.1290-1297, 2014 (SCI-Expanded) Creative Commons License identifier identifier identifier

Protonated Dipeptide Losses from b(5) and b(4) Ions of Side Chain Hydroxyl Group Containing Pentapeptides

Atik A. E., Yalcin T.
JOURNAL OF THE AMERICAN SOCIETY FOR MASS SPECTROMETRY , cilt.24, sa.10, ss.1543-1554, 2013 (SCI-Expanded) Creative Commons License identifier identifier identifier

The role of lysine epsilon-amine group on the macrocyclization of b ions

Atik A. E., Gorgulu G., Yalcin T.
INTERNATIONAL JOURNAL OF MASS SPECTROMETRY , cilt.316, ss.84-90, 2012 (SCI-Expanded) Creative Commons License identifier identifier

A Systematic Study of Acidic Peptides for b-Type Sequence Scrambling

Atik A. E., Yalcin T.
JOURNAL OF THE AMERICAN SOCIETY FOR MASS SPECTROMETRY , cilt.22, sa.1, ss.38-48, 2011 (SCI-Expanded) Creative Commons License identifier identifier identifier

Proteomic changes during boron tolerance in barley (Hordeum vulgare) and the role of vacuolar proton-translocating ATPase subunit E

ATIK A. E., BOZDAG G. O., Akinci E., KAYA A., KOC A., YALCIN T., et al.
TURKISH JOURNAL OF BOTANY , cilt.35, sa.4, ss.379-388, 2011 (SCI-Expanded) identifier identifier
Diğer Dergilerde Yayınlanan Makaleler

Effects of thermal treatment on quality of biosimilar and originator monoclonal antibodies

Erdemgil Y., Yamacı M. Ç., Pamukcu C., Ünalp F., Yıldırım Keleş Z. Z., Atik A. E., et al.
ADVANCES IN SAMPLE PREPARATION , cilt.10, 2024 (ESCI) Sürdürülebilir Kalkınma identifier identifier

Comparative Analysis of Glycoform Profiles Between Biosimilar and Originator Monoclonal Antibodies by Liquid Chromatography–Mass Spectrometry

Atik A. E.
Journal of the Turkish Chemical Society, Section A: Chemistry , cilt.11, sa.1, ss.365-376, 2024 (Hakemli Dergi)

Physicochemical and Functional Characterization of a Candidate Adalimumab Biosimilar TUR01

Atik A. E., Demirhan D., Alpan R. S.
25th European Society for Animal Cell Technology Meeting, BMC Proceedings , cilt.12, ss.13, 2018 (Düzenli olarak gerçekleştirilen hakemli kongrenin bildiri kitabı)
Hakemli Bilimsel Toplantılarda Yayımlanmış Bildiriler

Characterization of Lysine Glycation in Protein Therapeutics by Mass Spectrometry

Atik A. E.
5th Turkish National Proteomics Congress, Ankara, Türkiye, 13 - 14 Ekim 2023, ss.18, (Özet Bildiri)

Biosimilarity Demonstration with Orthogonal Analytical Techniques

Atik A. E.
6th International Congress on Applied Biological Science, Adana, Türkiye, 8 - 09 Aralık 2021, ss.15-18, (Tam Metin Bildiri) Sürdürülebilir Kalkınma

Analytical Characterization for the Comparability Evaluation of TUR03 Drug Substance and Innovator Lots by Mass Spectrometry

Atik A. E.
3rd International Congress on Analytical and Bioanalytical Chemistry, İstanbul, Türkiye, 22 - 26 Mart 2021, ss.77-78, (Tam Metin Bildiri)

Terapötik Monoklonal Antikorun Stres Koşulları Altında Bağlanma Özelliklerinin İncelenmesi

Atik A. E., Demirhan D., Can Ö., Alpan R. S.
3. Ulusal Proteomik Konferansı (TUPA), İstanbul, Türkiye, 27 - 29 Şubat 2020, ss.42, (Tam Metin Bildiri)

Monoklonal Antikor Yapısındaki Biyobenzer ve Referans İlaçların Stres Koşullarındaki Davranışlarının Kütle Spektrometresi ile İncelenmesi

Atik A. E.
3. Ulusal Proteomik Kongresi (TUPA), İstanbul, Türkiye, 27 - 29 Şubat 2020, ss.21, (Tam Metin Bildiri)

Gas-Phase Fragmentation Mechanisms Studies of Doubly-Protonated Peptide Ions Containing Basic Amino Acid Residues by Mass Spectrometry

Atik A. E., Yalçin T.
22nd International Mass Spectrometry Conference (IMSC), Florence, İtalya, 26 - 31 Ağustos 2018, ss.952-953, (Tam Metin Bildiri)

Comparison of Methionine Oxidation Profiles of Biosimilar TUR01 Monoclonal Antibody to Its Reference Under Oxidative Stress

Atik A. E.
22nd International Mass Spectrometry Conference (IMSC), Florence, İtalya, 26 - 31 Ağustos 2018, ss.511-512, (Tam Metin Bildiri)

Oksidatif Stres Altındaki Referans & Biyobenzer Monoklonal Antikorun Karşılaştırmalı Fizikokimyasal Analizleri

Atik A. E., Demirhan D., Can Ö., Serdar M. A.
2. Ulusal Proteomik Konferansı (TUPA), İstanbul, Türkiye, 24 - 25 Kasım 2017, ss.32, (Tam Metin Bildiri)

Biyobenzer Bir Monoklonal Antikorun Fonksiyonel ve Sitotoksik Özelliklerinin Belirlenmesi ve Referans Ürün ile Karşılaştırılması

Atik A. E., Demirhan D., Can Ö.
2. Ulusal Proteomik Konferansı (TUPA), İstanbul, Türkiye, 24 - 25 Kasım 2017, ss.40, (Tam Metin Bildiri)

Fragmentation Reactions of a7 Ions from Singly Protonated Model Heptapeptides Containing Glutamine Residue

Atik A. E., Yalçın T.
65th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics, Indiana, Amerika Birleşik Devletleri, 4 - 08 Haziran 2017, ss.105, (Tam Metin Bildiri)

Improvement of Glycosylation Profile to Increase Similarity of Adalimumab Biosimilar to the Innovator with High-Resolution Mass Spectrometry

Atik A. E., Demirhan D., Can Ö.
65th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics, Indiana, Amerika Birleşik Devletleri, 4 - 08 Haziran 2017, ss.186, (Tam Metin Bildiri)

Applying iTRAQ Proteomics and Systems Biology Approach to Understand the Glycosylated and Sialylated Pathways of CHO Mutants

Can Ö., Demirhan D., Atik A. E.
X Annual Congress of the European Proteomics Association (EuPA), İstanbul, Türkiye, 22 - 25 Haziran 2016, ss.25, (Özet Bildiri)

Investigation of Gas Phase Fragmentation Reaction Mechanism of Doubly-Protonated bn (n=7-9) Ions by Mass Spectrometry

Atik A. E., Yalçın T.
64th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics, Texas, Amerika Birleşik Devletleri, 5 - 09 Haziran 2016, ss.182, (Tam Metin Bildiri)

Investigation the Extent of in vitro Methylation of Glutamic Acid or Aspartic Acid Containing Model Peptides by Electrospray Ionization-Mass Spectrometry (ESI-MS)

Atik A. E., Yalçın T.
3rd Mediterranean Sea Region Countries Mass Spectrometry Workshop (MEDMS III), Athens, Yunanistan, 28 Haziran - 02 Temmuz 2015, ss.64, (Özet Bildiri)

Effect of Tyrosine Position on the Fragmentation Reactions of b3 Ions from Model Tripeptides

Atik A. E., Yalçın T.
20th International Mass Spectrometry Conference (IMSC), Geneve, İsviçre, 24 - 29 Ağustos 2014, ss.297, (Tam Metin Bildiri)

Infrared Multiple Photon Dissociation (IRMPD) Spectroscopy of b7 Ions from Model Acetylated Peptides

Atik A. E., Yalçın T.
3rd TAC Light Sources (SR & FEL) International Users' Meeting, Ankara, Türkiye, 5 - 07 Ekim 2013, ss.11-12, (Özet Bildiri)

A New Rearrangement Reaction of Peptide b Ions Containing Acetylated Lysine Residue

Atik A. E., Yalçın T.
61st ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics, Minnesota, Amerika Birleşik Devletleri, 9 - 13 Haziran 2013, ss.90, (Tam Metin Bildiri)

Effects of C-terminal Amide vs Carboxylic Acid Groups on the Dissociation of Deprotonated Model Peptides Containing Acidic Residue

Atik A. E., Yalçın T.
61st ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics, Minnesota, Amerika Birleşik Devletleri, 9 - 13 Haziran 2013, ss.90, (Tam Metin Bildiri)

The Role of Lysine ε-Amine Group on the Macrocyclization of b Ions

Atik A. E., Yalçın T.
60th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics, Vancouver, Kanada, 19 - 24 Mayıs 2012, ss.119, (Tam Metin Bildiri)

Characteristic Fragmentation Patterns of b5+ and b4+ Ions from Side Chain Hydroxyl Group Containing Pentapeptides

Atik A. E., Görgülü G., Yalçın T.
IX. Kimyasal Fizik Kongresi, İzmir, Türkiye, 14 - 16 Ekim 2010, ss.162, (Tam Metin Bildiri)

Protonlanmış Peptit Türevlerinin Reaksiyon Mekanizmalarının Kütle Spektrometresi ile İncelenmesi

Görgülü G., Atik A. E., Yalçın T.
XXIV. Ulusal Kimya Kongresi, Zonguldak, Türkiye, 29 Haziran - 02 Temmuz 2010, ss.375, (Özet Bildiri)

Effect of Acidic Amino Acid on b-Type Sequence Scrambling

Atik A. E., Yalçın T.
58th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics, Utah, Amerika Birleşik Devletleri, 23 - 27 Mayıs 2010, ss.144, (Tam Metin Bildiri)

Kütle Spektrometresinin Proteomik Çalışmalardaki Rolü

Atik A. E., Karakaya H. Ç., Koç A., Yalçın T.
XXII. Ulusal Kimya Kongresi, Gazimagusa, Kıbrıs (Kktc), 6 - 10 Ekim 2008, ss.60, (Özet Bildiri)

The Role of V-ATPase Subunit E on Boron Tolerance in Barley

Atik A. E., Karakaya H. Ç., Koç A., Yalçın T.
European Molecular Biology Organization (EMBO) Young Scientist Forum, İstanbul, Türkiye, 20 - 22 Şubat 2008, ss.10, (Özet Bildiri)

Strese Maruz Bırakılmış Bitkilerde Oluşan Yeni Proteinlerin 2D-Jel ve Kütle Spektrometresi ile Analizleri

Atik A. E., Karakaya H. Ç., Salih B., Yalçın T.
XX. Ulusal Kimya Kongresi, Kayseri, Türkiye, 4 - 08 Eylül 2006, ss.13, (Özet Bildiri)
Kitaplar

Nanoanalitik: Hücrenin Moleküler Düzeyde Nasıl Davrandığına Dair Bir Fikir Veren Kantitatif Analitik Araçlar

Atik A. E.
Nanobiyoteknoloji, Prof. Dr. Ata Akın, Editör, Türkiye Klinikleri Yayınevi, Ankara, ss.1-5, 2021
Metrikler

Yayın

41

Atıf (WoS)

49

H-İndeks (WoS)

4

Atıf (Scopus)

51

H-İndeks (Scopus)

4

Atıf (Scholar)

46

H-İndeks (Scholar)

2

Proje

6

Tez Danışmanlığı

1

Açık Erişim

6
BM Sürdürülebilir Kalkınma Amaçları