Eğitim Bilgileri
2005 - 2011
2005 - 2011Doktora
Sabancı Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyoloji Bilimleri ve Biyomühendislik, Türkiye
2003 - 2005
2003 - 2005Yüksek Lisans
Sabancı Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyoloji Bilimleri ve Biyomühendislik , Türkiye
1998 - 2003
1998 - 2003Lisans
Boğaziçi Üniversitesi, Fen-Edebiyat Fakültesi, Moleküler Biyoloji Ve Genetik Bölümü, Türkiye
Yaptığı Tezler
2011
2011Doktora
Protein engineering and covalent modification of Trichoderma reesei cellulases in Pichia pastoris for textile biofinishing
Sabancı Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyoloji Bilimleri ve Biyomühendislik
2005
2005Yüksek Lisans
Covalent modification of enzymes for textile processes
Sabancı Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyoloji Bilimleri ve Biyomühendislik
Araştırma Alanları
Biyoinformatik, Biyoteknoloji, Biyoreaktör, Çevre Biyoteknolojisi, Endüstriyel Biyoteknoloji, Mikrobiyal Biyoteknoloji, Moleküler Biyoloji ve Genetik , Temel Bilimler
Akademik Unvanlar / Görevler
2019 - Devam Ediyor
2019 - Devam EdiyorDoç.Dr.
Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Medikal Biyoteknoloji Bütünleşik Doktora Programı
2018 - 2019
2018 - 2019Doç.Dr.
İstanbul Arel Üniversitesi, Fen-Edebiyat Fakültesi, Moleküler Biyoloji Ve Genetik Bölümü
2017 - 2018
2017 - 2018Yrd.Doç.Dr.
İstanbul Arel Üniversitesi, Fen-Edebiyat Fakültesi, Moleküler Biyoloji Ve Genetik Bölümü
2014 - 2016
2014 - 2016Öğretim Görevlisi Dr.
Technische Universitaet Wien, Institute of Chemical, Environmental and Bioscience Engineering, Research Division of Biochemical Technology
Yönetimsel Görevler
2020 - Devam Ediyor
2020 - Devam EdiyorUZEM Danışma Kurulu Üyesi
Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Medikal Biyoteknoloji Doktora Programı
2020 - Devam Ediyor
2020 - Devam EdiyorEnstitü Yönetim Kurulu Üyesi
Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Medikal Biyoteknoloji Doktora Programı
2020 - Devam Ediyor
2020 - Devam EdiyorEnstitü Kurulu Üyesi
Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Medikal Biyoteknoloji Doktora Programı
2020 - Devam Ediyor
2020 - Devam EdiyorEnstitü Müdür Yardımcısı
Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Medikal Biyoteknoloji Doktora Programı
2019 - Devam Ediyor
2019 - Devam EdiyorEnstitü Orpheus Komisyonu Üyesi
Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Medikal Biyoteknoloji Doktora Programı
2019 - Devam Ediyor
2019 - Devam EdiyorAnabilim Dalı Akademik Kurul Üyesi
Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Medikal Biyoteknoloji Doktora Programı
2018 - 2019
2018 - 2019Bölüm Başkan Yardımcısı
İstanbul Arel Üniversitesi, Fen-Edebiyat Fakültesi, Moleküler Biyoloji Ve Genetik Bölümü
2017 - 2019
2017 - 2019Dekan Yardımcısı
İstanbul Arel Üniversitesi, Fen-Edebiyat Fakültesi
Verdiği Dersler
Yönetilen Tezler
Devam Ediyor
Devam EdiyorYüksek Lisans
Deep Learning for Antimicrobial Peptide Recognition
Bayram Akçapınar G. (Danışman)
H.Okan(Öğrenci)
Devam Ediyor
Devam EdiyorYüksek Lisans
Ankilozan Spondilitin Patogeneziyle İlgili ERAP1-ERAP2 Varyantlarının Hesaplamalı Analizi
Bayram Akçapınar G. (Danışman)
Y.Emre(Öğrenci)
Devam Ediyor
Devam EdiyorYüksek Lisans
Ankilozan Spondilitin İmmün Patogenezi için Moleküler Simülasyonlarla İmmünojenik Peptit- HLA-B2705 Etkileşimlerinin Yapısal Anlayışı
Bayram Akçapınar G. (Danışman)
S.Kıvrak(Öğrenci)
Devam Ediyor
Devam EdiyorYüksek Lisans
Mantar HidrofobinlerininÜç Boyutlu Yapılarının ve Ara Yüzey Ortamlarındaki Birikme Davranışlarının Açıklanması Üzerine Hesaplamalı Çalışma
Bayram Akçapınar G. (Danışman)
İ.Kara(Öğrenci)
SCI, SSCI ve AHCI İndekslerine Giren Dergilerde Yayınlanan Makaleler
2020
2020Evolutionary compromises in fungal fitness: hydrophobins can hinder the adverse dispersal of conidiospores and challenge their survival.
Cai F., Gao R., Zhao Z., Ding M., Jiang S., Yagtu C., et al.
The ISME journal, 2020 (SCI İndekslerine Giren Dergi)
2017
2017COMPARATIVE PHYSIOCHEMICAL ANALYSIS OF HYDROPHOBINS PRODUCED IN ESCHERICHIA COLI AND PICHIA PASTORIS
Przylucka A., Akcapinar G. , Bonazza K., Mello-de-Sousa T. M. , Mach-Aigner A. R. , Lobanov V., et al.
COLLOIDS AND SURFACES B-BIOINTERFACES, cilt.159, ss.913-923, 2017 (SCI İndekslerine Giren Dergi)
2017
2017HFB7-A novel orphan hydrophobin of the Harzianum and Virens clades of Trichoderma, is involved in response to biotic and abiotic stresses
Przylucka A., Akcapinar G. , Chenthamara K., Cai F., Grujic M., Karpenko J., et al.
FUNGAL GENETICS AND BIOLOGY, cilt.102, ss.63-76, 2017 (SCI İndekslerine Giren Dergi)
2017
2017Computational approaches for <i>de novo</i> design and redesign of metal-binding sites on proteins.
Akcapinar G. , Sezerman O. U.
Bioscience reports, cilt.37, 2017 (SCI İndekslerine Giren Dergi)
2016
2016The neutral metallopeptidase NMP1 of Trichoderma guizhouense is required for mycotrophy and self-defence
Zhang J., Akcapinar G. , Atanasova L., Rahimi M. J. , Przylucka A., Yang D., et al.
ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, cilt.18, ss.580-597, 2016 (SCI İndekslerine Giren Dergi)
2015
2015Molecular diversity of LysM carbohydrate-binding motifs in fungi
Akcapinar G. , Kappel L., Sezerman O. U. , Seidl-Seiboth V.
CURRENT GENETICS, cilt.61, ss.103-113, 2015 (SCI İndekslerine Giren Dergi)
2013
2013Stress effects caused by the expression of a mutant cellobiohydrolase I and proteasome inhibition in Trichoderma reesei Rut-C30
Kautto L., Grinyer J., Paulsen I., Tetu S., Pillai A., Pardiwalla S., et al.
NEW BIOTECHNOLOGY, cilt.30, ss.183-191, 2013 (SCI İndekslerine Giren Dergi)
2012
2012From in silico to in vitro: Modelling and production of Trichoderma reesei endoglucanase 1 and its mutant in Pichia pastoris
Akcapinar G. , Gul O., Sezerman U. O.
JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, cilt.159, ss.61-68, 2012 (SCI İndekslerine Giren Dergi)
2011
2011Effect of Codon Optimization on the Expression of Trichoderma reesei Endoglucanase 1 in Pichia pastoris
Akcapinar G. , Gul O., Sezerman U.
BIOTECHNOLOGY PROGRESS, cilt.27, ss.1257-1263, 2011 (SCI İndekslerine Giren Dergi)
Diğer Dergilerde Yayınlanan Makaleler
2016
2016Systems Biological Applications for Fungal Gene Expression
Akcapinar G. , SEZERMAN O. U.
GENE EXPRESSION SYSTEMS IN FUNGI: ADVANCEMENTS AND APPLICATIONS, ss.385-393, 2016 (Diğer Kurumların Hakemli Dergileri)
Hakemli Kongre / Sempozyum Bildiri Kitaplarında Yer Alan Yayınlar
2016
2016Rational design of novel Trichoderma hydrophobins for industrial applications
BAYRAM AKÇAPINAR G. , PRZYLUCKA A., Cai F., Mello De Sousa T. M. , Grothe H., Reimhult E., et al.
13th European Conference on Fungal Genetics, ECFG13, Paris, Fransa, 3 - 06 Nisan 2016
2016
2016Hydrophobins of Trichoderma guizhouense inhibit tomato defence system for successful colonization of rhizosphere
Cai F., BAYRAM AKÇAPINAR G. , Pryzlucka A., Pang G., Qirong S., Druzhinina I. S.
13th European Conference on Fungal Genetics, ECFG13, Paris, Fransa, 3 - 06 Nisan 2016
2015
2015Hydrophobins of Trichoderma as immobilizers of enzymes on polymeric surfaces for biocatalysis
Pryzlucka A., BAYRAM AKÇAPINAR G. , Boraca M., Kubicek C. P. , Druzhinina I. S.
Biotrans 2015, Viyana, Avusturya, 26 - 30 Temmuz 2015
2015
2015Modulation of surface properties of materials by engineered hydrophobins for effective biocatalysis
BAYRAM AKÇAPINAR G. , Pryzlucka A., Cai F., Shen Q., Kubicek C. P. , Druzhinina I. S.
Biotrans 2015, Viyana, Avusturya, 26 - 30 Temmuz 2015
2009
2009From in silico to in vitro Modelling and production of Trichoderma reesei endoglucanase 1 mutants in Pichia pastoris for textile biofinishing
BAYRAM AKÇAPINAR G. , GÜL Ö., SEZERMAN O. U.
III International Conference on Environmental, Industrial and Applied Microbiology “ (BioMicroWorld2009), Lizbon, Portekiz, 2 - 04 Aralık 2009
2008
2008Cloning of T reesei Cellulase Components in P pastoris and Impact of Loop Mutations on EGI of T reesei
BAYRAM AKÇAPINAR G. , GÜL Ö., SEZERMAN O. U.
International Enzyme Engineering Symposium (IEES’08), Aydın, Türkiye, 1 - 05 Ekim 2008
2007
2007Impact of mutations on thermal stability of T reesei EGII a computational study
BAYRAM AKÇAPINAR G. , Sezerman A. Ö. , SEZERMAN O. U.
13th European Congress on Biotechnology (Symbiosis), Barcelona, İspanya, 16 - 19 Eylül 2007, cilt.131, ss.259-260
2005
2005Immobilized Glucose Oxidase GOD for better stability and reuse in biobleaching of textiles
BAYRAM AKÇAPINAR G. , DAVULCU A., SEZERMAN A. Ö. , Taralp A., SEZERMAN O. U. , ANİŞ P., et al.
7th International Symposium on Biocatalysis and Biotransformations (BIOTRANS 2005), Delft, Hollanda, 3 - 08 Temmuz 2005
2005
2005Use of cellulase jeffamine networks in place of the free enzyme may alleviate the problem of lost fiber strength during textile processing
BAYRAM AKÇAPINAR G. , Duran K., Körlü Ekmekçi A., BAHTİYARİ M. İ. , Taralp A., SEZERMAN O. U.
229th National Meeting of the American-Chemical-Society, San Diego, Amerika Birleşik Devletleri, 13 - 17 Mart 2005
2004
2004Treatment of viscose with crosslinked commercial cellulases
BAYRAM AKÇAPINAR G. , Duran K., BAHTİYARİ M. İ. , Körlü Ekmekçi A., Taralp A., SEZERMAN O. U.
3rd International Conference on Textile Biotechnology (INTB04), Graz, Avusturya, 13 - 16 Haziran 2004
Desteklenen Projeler
2020 - 2023
2020 - 2023Kanserde İmmunoterapi Etkinliğinin İyileştirilmesine Yönelik Makine Öğrenmesine Dayalı Yeni Gen Keşfi ve İlaç Yeniden Konumlandırma Platformunun Geliştirilmesi
TÜBİTAK Projesi
Timuçin E. (Yürütücü) , BAYRAM AKÇAPINAR G.
2020 - 2022
2020 - 2022Auto-AMP: Derin Öğrenme ile Otomatik Antimikrobiyal Peptid Tanıma
Sağlık Bakanlığı
(Proje Özeti)
Bayram Akçapınar G. (Yürütücü) , Kanlıdere Z.
Bilimsel Kuruluşlardaki Üyelikler / Görevler
2020 - Devam Ediyor
2020 - Devam EdiyorAmerican Society of Microbiology
Üye
2006 - Devam Ediyor
2006 - Devam EdiyorEuropean Federation of Biotechnology
Üye
Bilimsel Hakemlikler
Eylül 2020
Eylül 2020APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY
SCI Kapsamındaki Dergi
Mayıs 2020
Mayıs 2020APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY
SCI Kapsamındaki Dergi
Mayıs 2020
Mayıs 2020Process Biochemistry
SCI Kapsamındaki Dergi
Atıflar
Toplam Atıf Sayısı (WOS): 137
h-indeksi (WOS): 7
Bilimsel Araştırma / Çalışma Grubu Üyelikleri
2019 - Devam Ediyor
2019 - Devam EdiyorCa17127-Euroscitizen
http://www.euroscitizen.eu/
COST ACTION, Belgium
2018 - Devam Ediyor
2018 - Devam Ediyor