Eğitim Bilgileri
2020 - Devam Ediyor
2020 - Devam EdiyorDoktora
Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Medikal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı, Türkiye
2017 - 2020
2017 - 2020Yüksek Lisans
Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Medikal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı, Türkiye
2011 - 2016
2011 - 2016Lisans
Yeditepe Üniversitesi, Genetik ve Biyomühendislik, Türkiye
Sertifika, Kurs ve Eğitimler
2024
2024Organ on a Chip Masterclass
Yeni Ürün Geliştirme
OrChESTRA Project Coordination Team
2021
2021ISO 13485:2016 Quality Management System for Medical Devices
Kalite Yönetimi
Prem R&D Consultancy
2021
2021ISO 13485:2016 Internal Auditor Theorical and Practical training
Kalite Yönetimi
Prem R&D Consultancy
Araştırma Alanları
Biyoteknoloji
Genetik Mühendisliği
Kanser Moleküler Biyolojisi
Biyomühendislik
Akademik Faaliyetlere Dayalı Araştırma Alanları
Avesis Araştırma Alanları
WoS Araştırma Alanları
Scopus Araştırma Alanları
Makaleler
Tümü (11)
SCI-E, SSCI, AHCI (9)
SCI-E, SSCI, AHCI, ESCI (11)
ESCI (2)
Scopus (11)
TRDizin (1)
2026
20261. Isothiocyanate-modified A3B type zinc phthalocyanine: Synthesis, photophysicochemical characterization, and in vitro evaluation
Öztürk E., Kaplan E., Burat A. K., Özçeşmeci M., YAŞA ATMACA G., ERDOĞMUŞ A., et al.
Polyhedron
, cilt.290, 2026 (SCI-Expanded, Scopus)
2026
20262. Investigation of the photophysical, photochemical, and multifunctional biological properties of fluorinated zinc(ii) phthalocyanine functionalized with carboxylic acid
Özay G., Özçeşmeci M., IŞIK Ş., CAN KARANLIK C., Kalkan Burat A., ERDOĞMUŞ A., et al.
Dalton Transactions
, cilt.55, sa.5, ss.2100-2110, 2026 (SCI-Expanded, Scopus)
2026
20263. PEGylated isothiocyanate-functionalized zinc(II) phthalocyanine exhibits cell-type dependent photodynamic activity in 2D and 3D tumor models
Özçeşmeci M., IŞIK Ş., Samsunlu T., Kaplan E., YAŞA ATMACA G., Burat A. K., et al.
Journal of Photochemistry and Photobiology B: Biology
, cilt.275, 2026 (SCI-Expanded, Scopus)
2025
20254. Morpholinoethoxy-Substituted Cationic Metal-Free and Metallo Phthalocyanines: In Vitro Photodynamic Therapy Activities, PDT-Induced ROS Level Measurements, and Cellular Death Mechanism
Serhatli M., Isik Ş., Kalkan Burat A., Özçeşmeci M., Hamuryudan E., CAN Ö.
ACS BIO & MED CHEM AU
, cilt.5, sa.4, ss.766-777, 2025 (ESCI)
2025
20255. 2D and 3D in vitro photodynamic activities of tetra-substituted symmetric water-soluble cationic zinc(II) phthalocyanines on cancer
IŞIK Ş., Özçeşmeci M., Kalkan Burat A., Hamuryudan E., ERDOĞMUŞ A., CAN Ö., et al.
SCIENTIFIC REPORTS
, cilt.15, sa.1, 2025 (SCI-Expanded, Scopus)
2025
20256. Anti-angiogenic effects of cationic zinc (II) phthalocyanine derivatives through photodynamic therapy
Isik Ş., Özçeşmeci M., Kalkan Burat A., Hamuryudan E., CAN Ö., Serhatli M.
SCIENTIFIC REPORTS
, cilt.15, sa.1, ss.2498-0, 2025 (SCI-Expanded, Scopus)
2025
20257. Development of a Hydrogel Platform with GBM and Microglia: A Potential Glioblastoma Tumor Model
Işık Ş., YÜCEL D., HASIRCI V. N.
ACS APPLIED BIO MATERIALS
, cilt.8, sa.9, ss.14, 2025 (ESCI, Scopus)
2022
20228. Structure-based engineering of an antiangiogenic scFv antibody for soluble production in E. coli without loss of activity
Denizci Oncu M., Balcioglu B. K., Ozgur B., Ozturk H. U., Serhatli M., IŞIK Ş., et al.
BIOTECHNOLOGY AND APPLIED BIOCHEMISTRY
, cilt.69, sa.5, ss.2122-2137, 2022 (SCI-Expanded, Scopus)
2022
20229. Pegylated metal-free and zinc(II) phthalocyanines: synthesis, photophysicochemical properties and in vitro photodynamic activities against head, neck and colon cancer cell lines
Akkoc B., Samsunlu T., Isik Ş., Özçeşmeci M., YAŞA ATMACA G., ERDOĞMUŞ A., et al.
DALTON TRANSACTIONS
, cilt.51, sa.26, ss.10136-10147, 2022 (SCI-Expanded, Scopus)
2022
202210. The neutralization effect of montelukast on SARS-CoV-2 is shown by multiscale in silico simulations and combined in vitro studies
Durdagi S., Avsar T., Orhan M. D., Serhatli M., Balcioglu B. K., Ozturk H. U., et al.
MOLECULAR THERAPY
, cilt.30, sa.2, ss.963-974, 2022 (SCI-Expanded, Scopus)
2021
202111. Identifying specific matrix metalloproteinase-2-inhibiting peptides through phage display-based subtractive screening
Ozdemir Bahadir A., Balcioglu B. K., Serhatli M., IŞIK Ş., Erdag B.
TURKISH JOURNAL OF BIOLOGY
, cilt.45, sa.6, ss.674-682, 2021 (SCI-Expanded, Scopus, TRDizin)
Hakemli Bilimsel Toplantılarda Yayımlanmış Bildiriler
2024
20241. Nerve Tissue Model Development On A Micropatterned Surface
Tamay D. G., Arslantunali-Sahin D., IŞIK Ş., Kole G. E., YÜCEL D., Hasirci N., et al.
7th TERMIS World Congress, Washington, Amerika Birleşik Devletleri, 25 - 28 Haziran 2024, cilt.30, (Özet Bildiri)
2024
20242. Nerve Tissue Model Development on a Micropatterned Surface
Tamay D. G., ARSLANTUNALI ŞAHİN D., Işık Ş., KÖLE G. E., YÜCEL D., HASIRCI N., et al.
7th TERMIS (Tissue Engineering & Regenerative Medicine International Society) World Congress, Seattle Washington, Amerika Birleşik Devletleri, 25 - 28 Haziran 2024, (Özet Bildiri)
2024
20243. Production of an in vitro glioblastoma tumor microenvironment model with HAMA/dECM hydrogel
Yücel D., Hasırcı V. N., Işık Ş.
12th World Biomaterials Congress (WBC), Daegu, Güney Kore, 26 - 31 Mayıs 2024, (Özet Bildiri)
2022
20224. Development of a Nerve Tissue Model on a Micropatterned Surfacefor Axon Guidance and Neural Regeneration Investigations
Yücel D., Hasırcı V. N., Arslantunali Şahin D., Tamay D., Köle G. E., Işık Ş., et al.
26th International Biomedical and Science and Technology Symposium (BIOMED2022), Ankara, Türkiye, 25 - 27 Kasım 2022, ss.1, (Özet Bildiri)
Desteklenen Projeler
2024 - 2025
2024 - 2025In Vitro Glioblastoma Modeli Oluşturulması Ve Doğrulanması
TÜBİTAK Projesi , 1002 - Hızlı Destek Programı
Yücel D., Hasırcı V. N., Işık Ş. (Yürütücü)
2021 - 2024
2021 - 2024Mikrodesenli Yüzey Üzerinde Sinir Doku Modeli Oluşturulması, Akson Yönlendirme ve Sinir Hasarı İyileşme Süreçlerinin İncelenmesi
TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı
2020 - 2021
2020 - 2021Development of scFv-based recombinant neutralizing antibody against COVID-19
TÜBİTAK Projesi , 1004 - Mükemmeliyet Merkezi Destek Programı FAZ I
2018 - 2021
2018 - 2021Development of Phthalocyanine-Based Directed Theranostic Molecules for Solid Tumors
TÜBİTAK Projesi , 1003 - Öncelikli Alanlar Ar-Ge Projeleri Destekleme Programı