Investigation of Molecular Mechanism of Macrolide Resistance in Laboratory Mutant Helicobacter pylori
Tezin Türü: Doktora
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Medikal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2023
Tezin Dili: İngilizce
Öğrenci: Meltem Ayaş
Danışman: Yeşim Gürol
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Helicobacter pylori (H. pylori) dünya nüfusunun yarısından fazlasını enfekte eden, gastrit, peptik ülser, mide mukozası ile ilişkili lenfoid doku (MALT) lenfoması ve mide kanseri gibi hastalıkların gelişmesine neden olan bir bakteridir. H. pylori enfeksiyonunun birinci basamak tedavisinde kullanılan makrolid grubu bir antibiyotik olan klaritromisine karşı oluşan direnç tedavi başarısızlığının en önemli nedenidir. H. pylori' de klaritromisin direnci çoğunlukla 23S rRNA' nın V domaininde peptidil transferazı kodlayan bölgesindeki nokta mutasyonları ile ilişkilendirilse de bu bölge dışındaki mutasyonların direnç ile ilişkisi güncel araştırmalardandır. Bu tez çalışmasında, dirençli suşlarda yeni nesil dizileme teknolojisi (NGS) kullanılarak olası yeni makrolid direnç mekanizmalarının araştırılması hedeflenmiştir. Ayrıca dirençli olgularda klaritromisine alternatif olabilecek josamisinin H. pylori üzerindeki etkinliğinin araştırılması da çalışmanın hedeflerindendir. H. pylori G27 suşundan, agar dilüsyon metodu ile, Minimum inhibitör konsantrasyonu (MİK) değerleri sırasıyla 128 g/ml ve >256 g/ml olan iki adet dirençli mutant suş elde edilmiştir. Klaritromisin direncinden sorumlu olabilecek aday mutasyonlar (A2143G, T1495A, T1494A, T1490A, T1476A, G1472T) mutant 1 suşunda 23S rRNA bölgesinde gösterilmiştir. Ayrıca dirençli suşta ilk kez saptanan Sulfite exporter TauE/SafE ailesi proteinini kodlayan gendeki mutasyonun klaritromisin direnci veya çapraz direnç ile ilişkili olduğu düşünülerek ileri çalışmalar için hedef olarak gösterilmiştir. Ayrıca makrolid dirençli H. pylori şuşlarında josamisine çapraz direnç ilk kez bu tez çalışması ile gösterilmiştir.