Targeted Next-Generation Sequencing of Base Excision Repair Genes for Late-Onset Alzheimer`s and Parkinson Disease’s Risk

---

Tezin Türü: Doktora

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Medikal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2020

Tezin Dili: İngilizce

Öğrenci: Tuğçe Ertüzün

Danışman: Meltem Müftüoğlu

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Geç başlangıçlı Alzheimer hastalığı (LOAD) en yüksek prevelanslı multifaktöriyel nörodejeneratif bir hastalıktır. Oksidatif DNA hasarı ve baz eksizyon tamiri (BER) bozukluklarının LOAD etiyolojisi ve ilerlemesi üzerindeki rolleri bilinmektedir. Bununla birlikte, belirli BER genlerinin genetik varyantlarının LOAD hastalarında BER aktivitesinin azalmasına katkıda bulunup bulunmadığı ve LOAD'in risk, gelişme ve / veya ilerlemesi ile ilişkili olup olmadığı bilinmemektedir. Bu nedenle bu tez çalışmasında, insan urasil glikosilaz (UNG), insan endonükleaz VIII-benzeri DNA glikosilaz 1 (NEIL1) ve insan DNA polimeraz β (POLβ) 'nın promotörü, ekzon ve intron bölgeleri, hedeflenmiş yeni nesil sekanslama kullanılarak dizilendi. Türk LOAD hastaları ve yaş uyumlu kontrollerinin kan örnekleri, Brezilya LOAD hastalarının, yaş uyumlu ve yüksek patolojili kontrollerinin, temporal korteks (TC) ve beyincik (CE) post mortem dokuları çalışmaya dahil edildi. Ayrıca, sporadik Parkinson hastalığı (PD) hastalarının kan örnekleri de çalışmaya dahil edildi. Bilinen LOAD genetik risk faktörü olan Apoliprotein E (APOE) de BER gen varyantları ve APOE'nin birlikteliğini incelemek üzere sekanslandı. Türk LOAD hastanın kan örneklerinde rs1610925, rs2268406, rs80001089, rs1018782 ve rs1018783 varyantlarının ve LOAD-TC'de sadece UNG rs80001089'un istatistiksel olarak anlamlı derecede ilişkili olduğu bulunmuştur. Anlamlı UNG rs80001089 ve NEIL1 rs7182283 epistazı sadece LOAD TC örneklerinde rastlannıştur. APOE rs769446, PD ile ilişkili tek anlamlı varyanttır. Bu sonuçlar, APOE ε4 taşıyıcısı olmayanlarda önemli BER gen varyantlarının, LOAD riski ile ilişkili olabileceğini düşündürmektedir.