Investigation of UNG genetic variants in sporadic alzheimer disease

---

Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Medikal Biyoteknoloji Tezli Yüksek Lisans Programı, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2018

Tezin Dili: İngilizce

Öğrenci: ASLI SEMERCİ

Danışman: Meltem Müftüoğlu

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Oksidatif DNA hasarının birikmesi ve bu hasarı onaran baz eksizyon tamir (BER) mekanizmasındaki bozukluk sporadik Alzheimer hastalığının (AH) etiyolojisi ve patogenezinde rol oynamaktadır. Urasil DNA glikozilaz (UDG) urasil DNA lezyonunu keser ve nükleer ve mitokondriyal BER yolağının ilk basamağında yer alır. Sporadik Alzheimer hastalarının post-mortem beyin dokularında, Alzheimer fare modellerinde ve hücre hatlarında yapılan biyokimyasal, moleküler, hücresel ve davranış çalışmaları, sporadik AH'nın patogenezi ile UDG'nin ekspresyon ve aktivitesindeki azalmanın neden olduğu BER hasarı arasındaki güçlü ilişkiyi ortaya çıkarmıştır. UNG geninin sessizleştirilmesi sinir hücrelerini amiloid AβPP toksisitesine duyarlı kılmaktadır. Bu nedenle, bu çalışmada, UNG geni sporadik AH için genetik risk faktörü adayı olarak seçilmiştir. Sporadik Alzheimer hasta ve sağlıklı kontrol gruplarında UNG geni (promoter, ekzon ve intron bölgeleri) Ion-PGM NGS teknolojisi kullanılarak dizilendi ve önemli UNG gen varyantları Sanger sekanslama ile doğrulandı. Bu çalışma, sporadik AH için iki yeni genetik risk faktörü olduğunu ortaya çıkarmıştır (p <0.05). Ayrıca, bu çalışma aynı zamanda, sporadik AH'de UDG'nin ekspresyon, protein ve aktivite düzeylerindeki azalmanın, UNG gen varyant (lar) ından kaynaklanmadığını da göstermiştir. Key Words: Base excision repair, Genetic variant, Next generation sequencing, Sporadic Alzheimer disease, Uracil DNA glycosylase.