Klebsiella pneumoniae ve Escherichia coli kökenlerinde polistren ve cam pleytlerde uygulanan sıvı mikrodilüsyon yöntemleri, kalsiyum eklenmiş Mueller-Hinton agarda E-test yöntemi ve VITEK2 kolistin duyarlılık sonuçlarının karşılaştırılması


Ayaş M.

Uluslarası 38. Türk Mikrobiyoloji Kongresi, Antalya, Türkiye, 4 - 08 Kasım 2018, ss.168, (Özet Bildiri)

  • Yayın Türü: Bildiri / Özet Bildiri
  • Basıldığı Şehir: Antalya
  • Basıldığı Ülke: Türkiye
  • Sayfa Sayıları: ss.168
  • Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi Adresli: Hayır

Özet

Amaç: “CLSI-EUCAST Polimiksin Klinik Sınır Değer Çalışma Grubu”, kolistin duyarlılığının saptanmasında referans yöntem olarak sıvı mikrodilüsyon (SMD) yöntemini önermiştir. Ancak bu yöntemin uygulanmasında yaşanan güçlükler araştırmacıları uygulaması daha kolay ve maliyet etkin yöntemlerin araştırılmasına itmiştir. Gwozdzinski ve ark. kalsiyum eklenmiş Mueller-Hinton agarın (Ca-MHA) kullanıldığı agar dilüsyon yöntemi ile güvenilir kolistin duyarlılık sonuçları elde ettiklerini belirtmişler ve bu besiyerinin kolistin gradiyent diffüzyon yöntemi için de kullanılabileceğini ileri sürmüşlerdir. Ancak kolistinin moleküler yapısı nedeniyle agar içinde difüzyonun yetersiz olduğu pek çok araştırmacı tarafından gösterilmiştir. Ayrıca kolistin duyarlılık testlerinde kolistinin polistren ile bağlandığı ve bu durumun SMD test sonucunu etkileyebildiği çeşitli yayınlarda bildirilmiştir. Bunların yanı sıra rutin mikrobiyoloji laboratuvarlarında sıkça kullanılmakta olan otomatize sistemlerin kolistin duyarlılık sonuçlarının değerlendirildiği araştırma sayısı kısıtlıdır. Bu çalışmada amacımız Klebsiella pneumoniae (K. pneumoniae) ve Escherichia coli (E. coli) kökenlerinde polistren ve cam pleytlerde uygulanan SMD yöntemleri, Ca-MHA ile uygulanan E-test yöntemi ve VITEK2 ile elde edilen kolistin duyarlılık sonuçlarının güvenilirliğinin değerlendirilmesidir. Yöntem: Çalışmaya dahil edilen 48 K. pneumoniae ve 12 E. coli klinik kökenlerin tür düzeyinde tanımlanması Bruker Daltonics Microflex LT sistemi ve Bruker Biotyper software ver3.4 (Bruker Daltonics, Germany) ile gerçekleştirilmiştir. Kökenlerin antibiyotik duyarlılık testleri VITEK2 AST-N325 test kartları ile çalışılmıştır. mcr-1 geninin varlığı polimeraz zincir tepkimesi ile araştırılmıştır. Kolistin SMD testleri, EUCAST önerilerine göre cam ve polistiren pleytlerde ayrı ayrı çalışılırken gradiyent difüzyon test 5 mM kalsiyum klorür içeren Mueller-Hinton agar kullanılarak çalışılmıştır. Çalışmalarda E. coli ATCC 25922, P. aeruginosa ATCC 27853 ve E. coli NCTC 13846 kontrol kökenleri olarak kullanılmıştır. Bulgular: Kökenlerin hiçbirinde mcr-1 saptanmamış olup elde edilen kolistin duyarlılık sonuçları Şekil 1 ve Tablo 1’de özetlenmiştir. Sonuç: Çalışmamızda besiyerinin kalsiyum açısından zenginleştirilmesine karşın E-test yöntemi kolistin duyarlığının değerlendirilmesinde majör hatalara neden olmaktadır. VITEK2 sistemi ile elde edilen kolistin duyarlılık sonuçlarında esansiyel uyum oranının %95 ve üzerinde olduğu görülmüştür. Anahtar Kelimeler: Kolistin, MİK, Sıvı Dilüsyon,VİTEK, E-Test, Gradiyent Difüzyon Test