Asst. Prof.

Sinem ÖKTEM OKULLU


School of Medicine

Department of Basic Sciences

Medical Microbiology

Dissertations

2017

2017

Doctorate

MULTIPLEX-PCR BASED SCREENING AND COMPUTATIONAL MODELING OF VIRULENCE FACTORS AND T CELL MEDIATED IMMUNITY IN HELICOBACTER PYLORI INFECTIONS FOR ACCURATE CLINICAL DIAGNOSIS

Istanbul Technical University, Fen Bilimleri Enstitüsü

2009

2009

Postgraduate

Observable Real Time Electrophoresis

Yeditepe University, Instıtute Of Scıence

Certificates, Courses and Trainings

2019

2019

Tıp Eğitiminde Ölçme-Değerlendirme Kursu

Measurement and Evaluation

Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi

2018

2018

Biyotıp ve Sağlık Bilimlerinde Lisansüstü Danışmanlık (Orpheus Yaklaşımı) Eğitimi

Education Management and Planning

Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi

2018

2018

V. Tıp Eğitimi Günleri

Education Management and Planning

Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi

2018

2018

İş Başında Tıp Eğitimi

Education Management and Planning

Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi

Research Areas

Health Sciences, Natural Sciences, Engineering and Technology

Academic Titles / Tasks

2017 - Continues

2017 - Continues

Assistant Professor

Acibadem Mehmet Ali Aydinlar University, School of Medicine, Department of Basic Sciences

2009 - 2017

2009 - 2017

Lecturer

Acibadem Mehmet Ali Aydinlar University, School of Medicine, Department of Basic Sciences

Managerial Experience

2020 - Continues

2020 - Continues

Yıl Koordinatörü

Acibadem Mehmet Ali Aydinlar University, School of Medicine, Department of Basic Sciences

2020 - Continues

2020 - Continues

Anabilim Dalı Akademik Kurul Üyesi

Acibadem Mehmet Ali Aydinlar University, Graduate School of Health Sciences , Medical Biotechnology with Thesis

2020 - Continues

2020 - Continues

Anabilim Dalı Akademik Kurul Üyesi

Acibadem Mehmet Ali Aydinlar University, Graduate School of Health Sciences , Medical Biotechnology

2020 - Continues

2020 - Continues

Anabilim Dalı Akademik Kurul Üyesi

Acibadem Mehmet Ali Aydinlar University, Graduate School of Health Sciences , Medikal Biyoteknoloji Doktora Programı

2020 - Continues

2020 - Continues

Coordinator of The Rectorate

Acibadem Mehmet Ali Aydinlar University, School of Medicine, Department of Basic Sciences

2018 - 2020

2018 - 2020

Program Koordinatörü

Acibadem Mehmet Ali Aydinlar University, School of Medicine, Department of Basic Sciences

2013 - 2020

2013 - 2020

Ders Kurulu Başkanı

Acibadem Mehmet Ali Aydinlar University, School of Medicine, Department of Basic Sciences

Courses

Associate Degree

Associate Degree

Moleküler Biyoloji Yöntemler

Undergraduate

Undergraduate

Microbial growth cultivation of microorganisms

Associate Degree

Associate Degree

Moleküler Biyolojik Yöntemler Uygulamaları

Undergraduate

Undergraduate

Pharmaceutical ımmunology

Postgraduate

Postgraduate

Molecular Techniques Used in Medical Biotechnology

Undergraduate

Undergraduate

Bacterial classification; Observation of microorganisms by microscopy

Undergraduate

Undergraduate

General structures of bacteria, mycoplasma, chlamydia & rickettsiae

Undergraduate

Undergraduate

Klinik Mikrobiyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları

Doctorate

Doctorate

Molecular Techniques Used in Medical Biotechnology and Applications

Postgraduate

Postgraduate

Immunology and ımmunotherapy

Associate Degree

Associate Degree

Tıbbi Mikrobiyoloji Uygulamaları I

Associate Degree

Associate Degree

Tıbbi Mikrobiyoloji I

Undergraduate

Undergraduate

Microbial pathogenesis

Undergraduate

Undergraduate

Antigens

Undergraduate

Undergraduate

Biomedical Technologies II

Undergraduate

Undergraduate

Microbiology

Doctorate

Doctorate

Applications in ımmunology and ımmunotharepy

Undergraduate

Undergraduate

Biomedical Technologies I

Undergraduate

Undergraduate

pharmaceutical microbiology

Undergraduate

Undergraduate

Gram positive cocci

Undergraduate

Undergraduate

Tıbbi Araştırma Projeleri

Undergraduate

Undergraduate

Tıbbi Araştırma Projeleri

Undergraduate

Undergraduate

Immunology

Designed Lessons

Associate Degree

Associate Degree

Moleküler Biyolojik yöntemler Uygulama

Ünübol N. , Öktem Okullu S. , Kocagöz Z. T.

Associate Degree

Associate Degree

Moleküler Biyolojik Yöntemler

Ünübol N. , Öktem Okullu S. , Kocagöz Z. T.

Taught Courses And Trainings

2021 - 2021

2021 - 2021

Laboratuvar Kuralları ve Güvenliği Eğitimi

Academic Units - Training

Mozioğlu E. , Akyar I. , Kocagöz Z. T. , Öktem Okullu S. , Ünübol N. , Bayram Akçapınar G.

2021 - 2021

2021 - 2021

Winter Science Camp for Highschool Students

Continuing Education Center - Certificate Program

Akın A. , Argunşah H. , Erdoğan S. B. , Kitapçıoğlu D. , Deniz E. , Keskin Toklu N. , et al.

2020 - 2020

2020 - 2020

Genç Bilim İnsanı Yetiştirme Programı-İlk Adım

Continuing Education Center - Training

Uçal Y. , Öktem Okullu S.

2019 - 2020

2019 - 2020

Tüm Boyutları ile Elektroforez Kursu

Academic Units - Course

Öktem Okullu S. , Kocagöz Z. T. , Ünübol N. , MOZİOĞLU E.

2019 - 2019

2019 - 2019

Lise Yaz Bilim Kampı II. Dönem

Academic Units - Training

Öktem Okullu S.

2019 - 2019

2019 - 2019

Laboratuvar Güvenliği Eğitimi

Academic Units - Training

Gürol Y. , ÖKTEM OKULLU S. , UÇAL Y.

2019 - 2019

2019 - 2019

Summer Science School for Highschool Students

Continuing Education Center - Training

Öktem Okullu S. , Mozioğlu E. , Akın A. , Çelebi A. R. C. , Kitapçıoğlu D. , Deniz E. , et al.

2019 - 2019

2019 - 2019

Laboratuvar Güvenliği Kursu

Academic Units - Course

Mozioğlu E. , Kocagöz Z. T. , Ünübol N. , Öktem Okullu S. , Müftüoğlu M. , Gürol Y.

2019 - 2019

2019 - 2019

ALIS 2019-Gel Electrophoresis

Academic Units - Course

Öktem Okullu S.

Articles Published in Journals That Entered SCI, SSCI and AHCI Indexes

2020

2020

PCR-based detection of intestinal protozoa in cancer and organ transplant recipient patients compared to a healthy control group

Öktem Okullu S. , Kurt Ö. , Akgül Ö., Çalışkan R.

International Journal of Clinical and Experimental Medicine, vol.13, no.6, pp.4434-4440, 2020 (Journal Indexed in SCI Expanded)

2019

2019

Biocidal activity of ROMP- polymer coatings containing quaternary phosphonium groups

Demir C., Ceren Süer N., Yapaöz M. A. , Kébir N., Okullu S. , Kocagöz T. , et al.

Progress in Organic Coatings, vol.135, pp.299-305, 2019 (Journal Indexed in SCI) identifier identifier

2012

2012

Synthesis and antimycobacterial activity of some phthalimide derivatives

AKGÜN H., Karamelekoglu I., Berk B., KURNAZ I., Saribiyik G., Oktem S. , et al.

Bioorganic and Medicinal Chemistry, vol.20, no.13, pp.4149-4154, 2012 (Journal Indexed in SCI) identifier identifier identifier

2012

2012

Efficiency of the TK Culture System in the diagnosis of tuberculosis.

Kocagoz T. , Altin S., Turkyilmaz O., Tas I., Karaduman P., Bolaban D., et al.

Diagnostic microbiology and infectious disease, vol.72, no.4, pp.350-7, 2012 (Journal Indexed in SCI) identifier identifier identifier

2011

2011

Molecular modeling and antimycobacterial studies of Mannich bases: 5-hydroxy-2-methyl-4H-pyran-4-ones

Berk B., Us D., Oktem S. , KOCAGÖZ Z. T. , Caglayan B., KURNAZ I., et al.

TURKISH JOURNAL OF CHEMISTRY, vol.35, no.2, pp.317-330, 2011 (Journal Indexed in SCI) identifier identifier

2009

2009

4H-Pyran-4-one derivatives:; leading molecule for preparation of compounds with antimycobacterial potential

Us D., Gurdal E., Berk B., Oktem S. , Kocagoz T. , Caglayan B., et al.

Turkish Journal of Chemistry, vol.33, no.6, pp.803-812, 2009 (Journal Indexed in SCI) identifier identifier identifier

Articles Published in Other Journals

2019

2019

Detection of Five Parasites in Renal Transplantation Patientsby Molecular Methods

AKGÜL Ö., Kırkoyun Yysal H., tosun i., SAPMAZ B., ÇALIŞKAN R., YAZICI GÜVERCİN A. C. , et al.

Aydın Tıp Klinikleri dergisi, vol.2, pp.17-23, 2019 (Refereed Journals of Other Institutions)

Refereed Congress / Symposium Publications in Proceedings

2020

2020

Mikrobiyotamızdaki Mikrobiyomun Hastalıklarımız Üzerine Etkisi

ÖKTEM OKULLU S.

9. Ulusal Sağlıklı Yaşam Kongresi, İstanbul, Turkey, 08 October 2020, pp.24-25

2019

2019

Virulence factors of pathogens in microbiota and their relation with diseases

ÖKTEM OKULLU S.

3rd INTERNATIONAL HUMAN MICROBIOTA: IN HEALTH AND DISEASES CONGRESS, İstanbul, Turkey, 7 - 09 November 2019

2019

2019

Mikroorganizmaların aşı ve biyobelirteç hedefleri Virülans faktörleri

ÖKTEM OKULLU S.

20. Uluslararası katılımlı ulusal biyoteknoloji kongresi, Ankara, Turkey, 10 - 12 October 2019

2019

2019

Investigation of helicobacter pylori virulance factors and immune response in precancerous lesions.

Tıftıkcı A. , Öktem Okullu S. , Çiçek B. , İnce Ü. , Tözün A. N. , Sayı Yazgan A.

world congress of gastroenterology, İstanbul, Turkey, 21 September - 24 December 2019, vol.30, no.316, pp.316

2019

2019

İki Boyutlu Jel Elektoroforezi

ÖKTEM OKULLU S.

Tüm Boyutları ile Elektroforez Sempozyumu, İstanbul, Turkey, 27 June 2019

2019

2019

Seçmeli Dersler Uygulanmasının Üçüncü Yılında Acıbadem Tıp Fakültesi Deneyimi

Altıntaş L. , Öktem Okullu S. , Artvinli F. , Şahiner A. M.

Ulusal Tıp Eğitimi Sempozyumu 2019, Eskişehir, Turkey, 10 - 12 April 2019, vol.1, no.867420, pp.1-2

2018

2018

Bağırsak Mikrobiyotasında Özel Dostlar: Laktobasiller veBifidobakteriler

ÖKTEM OKULLU S.

7. ulusal sağlıklı yaşam sempozyumu, Turkey, 12 - 15 April 2018

2015

2015

Epidemiologic characterization of NDM-1 producing E. coli and K. pneumoniae isolates in Turkish hospitals.

Ünübol N. , Öktem Okullu S.

Congress of European Microbiologists, Maastricht, Netherlands, 7 - 11 June 2015, pp.169

2015

2015

correlation between h. pylori specific virulence factors and host immune response associated with clinical outcomes of the infection

ÖKTEM OKULLU S. , SARUÇ M., TİFTİKÇİ A., ÇİÇEK B., VARDARELİ N. E. , TÖZÜN A. N. , et al.

Federation of European Microbiological Societies (FEMS) 6th Congress of European Microbiologists, Maastricht, Netherlands, 7 - 11 June 2015

2015

2015

Epidemiological Characterization of NDM-1-Producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae Isolates in Turkish Hospitals

KARATUNA O., kaya d. e. , KOCAGÖZ A. S. , ÖKTEM OKULLU S. , Ünübol N., AKYAR I. , et al.

Federation of European Microbiological Societies (FEMS) 6th Congress of European Microbiologists, Maastricht, Netherlands, 7 - 11 June 2015

2014

2014

Development of Some Novel Thioureas Derived From 1 3 4 Thiadiazoles and 1 2 4 Triazoles as Antitubercular Agents

TATAR E., KÜÇÜKGÜZEL İ., KÜÇÜKGÜZEL Ş. G. , KARAKUŞ S., ÖKTEM OKULLU S. , Ünübol N., et al.

4th International Meeting on Pharmacy Pharmaceutical Sciences IMPPS-4, İstanbul, Turkey, 18 - 21 September 2014

2014

2014

New diflunisal hydrazones and thiazolidinones as anti HCV and antimicrobial agents

ŞENKARDEŞ S., ÖKTEM OKULLU S. , KOCAGÖZ Z. T. , KAUSHIK BASU N., MANVAR D., BASU A., et al.

4th International Meeting on Pharmacy Pharmaceutical Sciences IMPPS-4, İstanbul, Turkey, 18 - 21 September 2014

2014

2014

Synthesis and Antituberculosis Evaluation of 1 2 4 Triazole Derivatives Carrying Thioacetic Amide Structure

KULABAŞ N., TATAR E., KÜÇÜKGÜZEL İ., ÖKTEM OKULLU S. , Ünübol N., KOCAGÖZ Z. T.

4th International Meeting on Pharmacy Pharmaceutical Sciences IMPPS-4, İstanbul, Turkey, 18 - 21 September 2014

2014

2014

H-PYLORI CAGA(), VACAS1 M2(), AND HPAA() STRAINS PROMOTES T-HELPER 17 RESPONSE INSTEAD OF T HELPER 1 THAT LEADS TO INTESTINAL METAPLASIA IN TURKISH H-PYLORI-INFECTED GASTRITIS AND ULCER PATIENTS

ÖKTEM OKULLU S. , SARUÇ M., TİFTİKÇİ A., ÇİÇEK B., VARDARELİ N. E. , TÖZÜN A. N. , et al.

European-Helicobacter-Study-Group 27th International Workshop on Helicobacter and Microbiota in Chronic Digestive Inflammation and Gastric Cancer, Rome, Italy, 11 - 13 September 2014, vol.19, pp.98

2014

2014

H-PYLORI CAGA(+), VACAS1 M2(+), AND HPAA(+) STRAINS PROMOTES T-HELPER 17 RESPONSE INSTEAD OF T HELPER 1 THAT LEADS TO INTESTINAL METAPLASIA IN TURKISH H-PYLORI-INFECTED GASTRITIS AND ULCER PATIENTS

Okullu S. , Saruc M. , Tiftikci A. , Cicek B., Vardareli E. K. , Tozun N., et al.

European-Helicobacter-Study-Group 27th International Workshop on Helicobacter and Microbiota in Chronic Digestive Inflammation and Gastric Cancer, Rome, Italy, 11 - 13 September 2014, vol.19, pp.98 identifier

2012

2012

Elektroforez Sırasında Protein Moleküllerinin İzlenmesini Sağlayan Yatay Elektroforez Sistemi

Ünübol N. , Öktem Okullu S.

17. Ulusal Biiyoteknoloji Kongresi, İstanbul, Turkey, 23 - 26 September 2012, pp.1-3

2012

2012

A Horizontal Electrophoresis Gel System Which Enables Visualization of Proteins During Electrophoresis

Ünübol N. , Öktem Okullu S.

15th European Congress on Biotechnology, İstanbul, Turkey, 23 - 26 September 2012, pp.64-65

2012

2012

Revolutionizing Decontamination and Concenteration Methodfor the diagnosis of Tuberculosis

Ünübol N. , Öktem Okullu S.

ASM 2012, California, United States Of America, 16 - 19 June 2012, pp.373

2010

2010

PZT de Kullanılan PolimerazÖzellikleri ve Kullanım Amaçları

ÖKTEM OKULLU S.

6. Ulusal Tanısal ve Moleküler Mikrobiyoloji Kongresi, Ankara, Turkey, 15 - 19 June 2010

2009

2009

TK PZA: M. tuberculosis'te Pirazinamid Duyarlılığını Hızlı Saptayabilen Yeni Bir Besiyeri

Ünübol N. , Öktem Okullu S.

Trabzon Mikobakteri Günleri, Trabzon, Turkey, 4 - 07 November 2009, pp.150

2008

2008

Optik Okuyuculu Elektroforez Sistemi ve Otomatik Molekül Büyüklüğü Belirleyicisi

KOCAGÖZ Z. T. , MOZİOĞLU E., ÖKTEM OKULLU S. , ENGİN E. D.

5. Ulusal Moleküler ve Tanısal Mikrobiyoloji Kongresi, Ankara, Turkey, 24 - 28 June 2008

2008

2008

Optik Okuyuculu Elektroforez Sistemi ve Otomatik Molekül Büyüklüğü Belirleyicisi

kocagöz t., MOZİOĞLU E. , öktem S. , Engin D., Yavuz S.

5.Ulusal Moleküler ve Tanısal Mikrobiyoloji Kongresi, Turkey, 24 June - 26 August 2008

Books & Book Chapters

2017

2017

BÖLÜM 22 Parazitoloji, Kan ve Doku Parazitleri

Us A. D. , BAŞUSTAOĞLU A. C. , USLUCA S., GÜRÜZ A. Y. , Adiloğlu A., Sığ A. K. , et al.

in: Koneman Renkli Atlas ve Tanısal Mikrobiyoloji Kitabı, Ahmet Başustaoğlu, A. Dürdal Us, Editor, Hipokrat Yayınevi, Ankara, pp.1418-1492, 2017

2014

2014

Basis of Anti-Infective Therapy against Leishmaniasis and Future Perspectives

Öktem Okullu S.

in: Frontiers in Anti-Infective Drug Discovery, Atta-ur-Rahman,M. Iqbal Choudhary, Editor, Bentham Science, Illinois, pp.194-316, 2014

Scientific Refereeing

July 2020

July 2020

TUBITAK Project

2209-A - Üniversite Öğrencileri Araştırma Projeleri Destekleme Programı, Acibadem Mehmet Ali Aydinlar University, Turkey

July 2020

July 2020

TUBITAK Project

2209-A - Üniversite Öğrencileri Araştırma Projeleri Destekleme Programı, Acibadem Mehmet Ali Aydinlar University, Turkey

July 2020

July 2020

TUBITAK Project

2209-A - Üniversite Öğrencileri Araştırma Projeleri Destekleme Programı, Acibadem Mehmet Ali Aydinlar University, Turkey

July 2020

July 2020

TUBITAK Project

2209-A - Üniversite Öğrencileri Araştırma Projeleri Destekleme Programı, Acibadem Mehmet Ali Aydinlar University, Turkey

July 2020

July 2020

TUBITAK Project

2209-A - Üniversite Öğrencileri Araştırma Projeleri Destekleme Programı, Acibadem Mehmet Ali Aydinlar University, Turkey

April 2020

April 2020

TUBITAK Project

3501 - National Young Researcher Career Development Program, Acibadem Mehmet Ali Aydinlar University, Turkey

April 2020

April 2020

TUBITAK Project

3501 - National Young Researcher Career Development Program, Acibadem Mehmet Ali Aydinlar University, Turkey

January 2020

January 2020

TUBITAK Project

2209-A - Üniversite Öğrencileri Araştırma Projeleri Destekleme Programı, Acibadem Mehmet Ali Aydinlar University, Turkey

January 2020

January 2020

TUBITAK Project

2209-A - Üniversite Öğrencileri Araştırma Projeleri Destekleme Programı, Acibadem Mehmet Ali Aydinlar University, Turkey

January 2020

January 2020

TUBITAK Project

2209-A - Üniversite Öğrencileri Araştırma Projeleri Destekleme Programı, Acibadem Mehmet Ali Aydinlar University, Turkey

January 2020

January 2020

TUBITAK Project

2209-A - Üniversite Öğrencileri Araştırma Projeleri Destekleme Programı, Acibadem Mehmet Ali Aydinlar University, Turkey

January 2020

January 2020

TUBITAK Project

2209-A - Üniversite Öğrencileri Araştırma Projeleri Destekleme Programı, Acibadem Mehmet Ali Aydinlar University, Turkey

May 2019

May 2019

ICGEB Supported Project

Acibadem Mehmet Ali Aydinlar University, Turkey

Tasks In Event Organizations

Mart 2020

Mart 2020

Medikal Biyoteknoloji Kongresi

Scientific Congress

Öktem Okullu S.
İstanbul, Turkey

Awards

April 2010

April 2010

Dr. Akın Çakmakçı Üniversite Sanayi İşbirliğinde En Başarılı Tez Ödülü

Türkiye Teknoloji Geliştirme Vakfı



Edit Congress and Symposium Activities

2020

2020

9. ulusal sağlıklı yaşam kongresi

Invited Speaker

İstanbul-Turkey

2018

2018

7. Ulusal Sağlıklı Yaşam Sempozyumu

Invited Speaker

İstanbul-Turkey

Invited Talks

April 2018

April 2018

Sağlıklı Yaşam Sempozyumu

Conference

Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi-Turkey

Citations

Total Citations (WOS): 131

h-index (WOS): 7