Akademik Veri Yönetim Sistemi
Baykal A. T., Serteser M. (Yürütücü)
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje, 2023 - 2024
SARS-CoV-2 (severe acute respiratory syndrome coronavirus 2) tarafından enfekte olan bireylerde ortaya çıkan ve COVID 19 (coronavirus disease 2019) pandemisine sebebiyet vermiş viral ajanla ve insan vücuduna etkisiyle ilgili birçok çalışma günümüze kadar yapılmıştır. Ancak, vücuttaki metabolik yolaklara ve bu yolaklar üzerindeki farklı analitlere (lipoproteinler ve alt fraksiyonları, alkol türevleri, keton cisimcikleri türevleri, karboksilik asitler ve amino asitler ile türevleri, vb.) olan etkisi çeşitli çalışmalarla keşfedilmeye çalışılsa da henüz tam olarak netlik kazanmamıştır; özellikle gerçek zamanlı olarak toplanmış örneklerle yapılan çalışmalar oldukça azdır. Çalışmamızda amaçlanan hedefimiz, 2020 yılı nisan ayında COVID 19 enfeksiyonu tanısı almış ve yoğun bakım koşulları gerektirecek şekilde kötüleşmiş hastalardan gerçek zamanlı toplanan ve -80 derecede korunan her hastaya ait serum ve idrar örneklerinde, 1H-NMR yöntemi kullanarak farklı metabolitlerin farklı matrikslerde (serum ve idrar) korelasyonlarını ve değişimlerini gözlemlemek, ayrıca bunu farklı prognostik süreçlere (iyi hal ile taburcu, polinöropatik sekel ve vefat) sahip olmuş hastalar arasında da değerlendirerek; çalışmaya dahil edilen hastalar ile bu hastalara ait serum/idrar örneklerindeki metabolitlerin dalgalanmalarını özgün bir şekilde ortaya koyabilmektir.
Çalışmaya dahil edilecek olan hastalara (N=8, İyi hal ile taburcu (4), Polinöropatik sekel (2), Vefat (2) ) ait gerçek zamanlı toplanmış (10.04.2020-28.04.2020) ve stabiliteyi korumak amacıyla uygun şekilde korunmuş (-80°C ) serum (N=72 – 8 hasta için toplam sayı) ve idrar (N=72 – 8 hasta için toplam sayı) örnekleri (TN=144) ayrı ayrı 1H-NMR yöntemi ile NMR Spektroskopi Cihazı (Avance IVDr, Bruker) analiz edilecek ve incelenecek olan analitlere ait değişimler, yoğun bakımda yatmış ve farklı prognostik süreçlere sahip olmuş hastalar arasında hem birey içi hem de bireyler arası dalgalanmalar gözetilerek; ayrıca aynı hastaya ait idrar ve serum örnekleri arasındaki değişimler de değerlendirilerek, hastalık sürecinin metabolik düzeydeki etkisinin farklı prognozdaki yoğun bakım hastaları üzerindeki etkisinin farklı örnek tiplerinde aydınlatılması sağlanacaktır. Dahası, çalışmaya dahil edilecek hastalara ait numuneler pandeminin başladığı tarihlerde (Nisan 2020) toplanmış ve uygun şekilde korunmuş olduğundan dolayı, sonraki süreçlerde ortaya çıkan çeşitli aşıların (Sinovac, Biontech, vs.) immünolojik interferans etkileri de önlenmiş bir şekilde analiz yapılmış olacaktır ve bu yönüyle de yapılan önceki metabolomiks çalışmalarından olan farklılığını ve özgünlüğünü koruyacaktır.