Eğitim Bilgileri
2013 - 2017
2013 - 2017Doktora
Bursa Uludağ Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Moleküler Biyoloji Programı, Türkiye
2011 - 2013
2011 - 2013Yüksek Lisans
Bursa Uludağ Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Moleküler Biyoloji Programı, Türkiye
2006 - 2011
2006 - 2011Lisans
Bursa Uludağ Üniversitesi, Fen-Edebiyat Fakültesi, Biyoloji, Türkiye
Yaptığı Tezler
2017
2017Doktora
Pankreas kanseri ve tümör mikroçevresinin ökaryotik elongasyon faktörü 2 kinaz (EF2K) enzim inhibisyonu aracılığıyla hedeflenmesi
Bursa Uludağ Üniversitesi
2013
2013Yüksek Lisans
Kültür ortamında fibroblastların varlığında A-549 akciğer kanseri hücre hattının farklı kemoterapi ilaçlarına verdiği yanıtın araştırılması
Bursa Uludağ Üniversitesi
Araştırma Alanları
Moleküler Biyoloji ve Genetik
Akademik Unvanlar / Görevler
2023 - Devam Ediyor
2023 - Devam EdiyorDr. Öğr. Üyesi
Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Medikal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
2017 - 2022
2017 - 2022Dr. Öğr. Üyesi
İstinye Üniversitesi, Mühendislik ve Doğa Bilimleri Fakültesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik
Verdiği Dersler
SCI, SSCI ve AHCI İndekslerine Giren Dergilerde Yayınlanan Makaleler
2025
2025Organoids, tissue slices and organotypic cultures: Advancing our understanding of pancreatic ductal adenocarcinoma through in vitro and ex vivo models
AKSOY S., Earl J., Grahovac J., KARAKAŞ ZEYBEK D., Lencioni G., Sigirli S., et al.
SEMINARS IN CANCER BIOLOGY
, cilt.109, ss.10-24, 2025 (SCI-Expanded)
2024
2024Harnessing acetylsalicylic acid to counteract pancreatic stellate cell-mediated tumor promotion
Sigirli S., Karakaş Zeybek D., Ulukaya E., Demir I. E., Ceyhan G. O.
FEBS OPEN BIO
, ss.310, 2024 (SCI-Expanded)
2023
2023Synthesis, Characterization and Apoptosis Capabilities of a Novel Naphthoquinone-Derived Compound in Triple-Negative Breast Cancer
Adacan K., GÖKMEN Z., Okan Akar R., Ozyildiz Z., Dincer H., KARAKAŞ ZEYBEK D., et al.
CHEMISTRYSELECT
, cilt.8, sa.43, 2023 (SCI-Expanded)
2023
2023Targeting Periostin Expression Makes Pancreatic Cancer Spheroids More Vulnerable to Natural Killer Cells
KARAKAŞ ZEYBEK D., Erkisa M., Akar R. O., AKMAN G., Senol E. Y., Ulukaya E.
BIOMEDICINES
, cilt.11, sa.2, 2023 (SCI-Expanded)
2023
2023Evidence for heterogeneity in response to treatment in mammary tumors of dogs as happens in humans
TURNA Ö., ÜVEZ A., BAYKAL A., Develi E. S., Diramali M., SÖNMEZ K., et al.
VETERINARY RESEARCH COMMUNICATIONS
, cilt.47, sa.1, ss.111-120, 2023 (SCI-Expanded)
2021
2021Tumor Chemosensitivity Assays Are Helpful for Personalized Cytotoxic Treatments in Cancer Patients
Ulukaya E., KARAKAŞ ZEYBEK D., Dimas K.
MEDICINA-LITHUANIA
, sa.6, 2021 (SCI-Expanded)
2021
2021UV radiation resistance-associated gene (UVRAG) promotes cell proliferation, migration, invasion by regulating cyclin-dependent kinases (CDK) and integrin-β/Src signaling in breast cancer cells
Sencan S., Tanriover M., Ulasli M., KARAKAŞ ZEYBEK D., Ozpolat B.
MOLECULAR AND CELLULAR BIOCHEMISTRY
, cilt.476, sa.5, ss.2075-2084, 2021 (SCI-Expanded)
2021
2021ncRNA therapy with miRNA-22-3p suppresses the growth of triple-negative breast cancer
Gorur A., Bayraktar R., Ivan C., Mokhlis H. A., Bayraktar E., Kahraman N., et al.
MOLECULAR THERAPY-NUCLEIC ACIDS
, cilt.23, ss.930-943, 2021 (SCI-Expanded)
2020
2020Eukaryotic elongation factor-2 kinase (eEF2K) signaling in tumor and microenvironment as a novel molecular target
Karakas D., Ozpolat B.
JOURNAL OF MOLECULAR MEDICINE-JMM
, cilt.98, sa.6, ss.775-787, 2020 (SCI-Expanded)
2019
2019Unfolded Protein Response is Involved in Trans-Platinum (II) Complex-Induced Apoptosis in Prostate Cancer Cells via ROS Accumulation
Karakas D., Cevatemre B., YILMAZTEPE ORAL A., YILMAZ V. T., Ulukaya E.
ANTI-CANCER AGENTS IN MEDICINAL CHEMISTRY
, cilt.19, sa.9, ss.1184-1195, 2019 (SCI-Expanded)
2019
2019A novel 1,4-naphthoquinone-derived compound induces apoptotic cell death in breast cancer cells
Karakas D., Akar R. O., GÖKMEN Z., DENİZ N. G., Ulukaya E.
TURKISH JOURNAL OF BIOLOGY
, cilt.43, sa.4, ss.256-263, 2019 (SCI-Expanded)
2018
2018Dual Suppressive Effect of miR-34a on the FOXM1/eEF2-Kinase Axis Regulates Triple-Negative Breast Cancer Growth and Invasion
Bayraktar R., Ivan C., Bayraktar E., Kanlikilicer P., Kabil N. N., Kahraman N., et al.
CLINICAL CANCER RESEARCH
, cilt.24, sa.17, ss.4225-4241, 2018 (SCI-Expanded)
2018
2018A promising natural product, pristimerin, results in cytotoxicity against breast cancer stem cells in vitro and xenografts in vivo through apoptosis and an incomplete autopaghy in breast cancer
Cevatemre B., Erkisa M., AZTOPAL N., Karakas D., Alper P., Tsimplouli C., et al.
PHARMACOLOGICAL RESEARCH
, cilt.129, ss.500-514, 2018 (SCI-Expanded)
2017
2017Synthesis, biological characterization and evaluation of molecular mechanisms of novel copper complexes as anticancer agents
Acilan C., Cevatemre B., Adiguzel Z., Karakas D., Ulukaya E., Ribeiro N., et al.
BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-GENERAL SUBJECTS
, cilt.1861, sa.2, ss.218-234, 2017 (SCI-Expanded)
2017
2017A trans-platinum(II) complex induces apoptosis in cancer stem cells of breast cancer
AZTOPAL N., Karakas D., Cevatemre B., ARI F., İÇSEL YILMAZ C., Daidone M. G., et al.
BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY
, cilt.25, sa.1, ss.269-276, 2017 (SCI-Expanded)
2017
2017The MTT viability assay yields strikingly false-positive viabilities although the cells are killed by some plant extracts
Karakas D., ARI F., Ulukaya E.
TURKISH JOURNAL OF BIOLOGY
, cilt.41, sa.6, ss.919-925, 2017 (SCI-Expanded)
2017
2017Cytotoxic and apoptotic effects of the combination of palladium (II) 5,5-diethylbarbiturate complex with bis(2-pyridylmethyl)amine and curcumin on non small lung cancer cell lines
Tunc D., DERE E., Karakas D., Cevatemre B., YILMAZ V. T., Ulukaya E.
BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY
, cilt.25, sa.5, ss.1717-1723, 2017 (SCI-Expanded)
2015
2015Design, Synthesis, Biological Evaluation, and Antioxidant and Cytotoxic Activity of Heteroatom-Substituted 1,4-Naphtho- and Benzoquinones
DENİZ N. G., Ibis C., GÖKMEN Z., Stasevych M., Novikov V., Komarovska-Porokhnyavets O., et al.
CHEMICAL & PHARMACEUTICAL BULLETIN
, cilt.63, sa.12, ss.1029-1039, 2015 (SCI-Expanded)
2015
2015Addition of niclosamide to palladium(II) saccharinate complex of terpyridine results in enhanced cytotoxic activity inducing apoptosis on cancer stem cells of breast cancer
Karakas D., Cevatemre B., AZTOPAL N., ARI F., YILMAZ V. T., Ulukaya E.
BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY
, cilt.23, sa.17, ss.5580-5586, 2015 (SCI-Expanded)
2014
2014Cancer stem cells: emerging actors in both basic and clinical cancer research
Karakas D., Cevatemre B., Ulukaya E.
TURKISH JOURNAL OF BIOLOGY
, cilt.38, sa.6, ss.829-838, 2014 (SCI-Expanded)
Diğer Dergilerde Yayınlanan Makaleler
2024
2024Evaluation the Effect of Tumor-Associated Macrophage-Derived Factors on Pancreatic Cancer Microenvironment Cells.
Karakaş Zeybek D., Dere E., Ulukaya E., Ozpolat B.
Acıbadem Üniversitesi Sağlık Bilimleri Dergisi , cilt.16, sa.1, ss.24-31, 2024 (Hakemli Dergi)
2024
2024Protocol for whole-mount immunofluorescence staining of ECM gel-embedded innervated pancreatic organoids
Besikcioglu H. E., Yurteri U., Ye L., Zhang F., Moretti A., Guercinar I. H., et al.
STAR PROTOCOLS
, cilt.5, sa.2, 2024 (ESCI)
2021
2021The Role of LncRNAs in Translation
Karakas D., Ozpolat B.
NON-CODING RNA
, cilt.7, sa.1, ss.1-14, 2021 (ESCI)
2019
2019Cancer stem cells: Root of the evil
Erkisa M., Karakas D., Ulukayad E.
Critical Reviews in Oncogenesis
, cilt.24, sa.1, ss.69-87, 2019 (Scopus)
2016
2016Validation data supporting the characterization of novel copper complexes as anticancer agents
Acilan C., Cevatemre B., Adiguzel Z., Karakas D., Ulukaya E., Ribeiro N., et al.
DATA IN BRIEF
, ss.1160-1174, 2016 (ESCI)
Desteklenen Projeler
2024 - 2027
2024 - 2027Pankreas Kanseri Gelişim Sürecinde Stellat Hücreleri ve Schwann Hücreleri Arasındaki Parakrin Etkileşimin Araştırılması Ve Bu Etkileşimde Rol Alan Moleküllerin Belirlenmesi
TÜBİTAK Projesi
Karakaş Zeybek D. (Yürütücü), Ceyhan G. O., Demir E., Süer Mickler H., Beşikcioğlu H. E.
2025 - 2026
2025 - 2026Kanser Kökenli Eksozom Alımına Bağlı Gen Ekspresyon Değişikliklerinin Hepatosellüler Kanser Tedavisinde Sorafenib Duyarlılığına Etkisi
TÜBİTAK Projesi
Sarımahmut M.(Yürütücü), Karakaş Zeybek D., Kara M.
2024 - 2025
2024 - 2025Aspirin Uygulanmış Pankreatik Stellat Hücrelerinin Pankreas Kanseri ile Schwann Hücreleri Arasındaki Etkileşime Olan Etkilerinin İncelenmesi: Bu Dinamik Etkileşimdeki Ana Moleküllerin Belirlenmesi
TÜSEB A Grubu Acil AR-GE Projesi
Karakaş Zeybek D. (Yürütücü), Ceyhan G. O.
2022 - 2025
2022 - 2025Akciğer Kanseri Hücrelerinde M6a Mrna Modifikasyonu Ile Doğal Öldürücü Hücre Yanıtı Arasındaki Ilişkinin Incelenmesi
TÜBİTAK Projesi
Aztopal N.(Yürütücü), Karakaş Zeybek D.
2022 - 2025
2022 - 2025Akciğer Kanserinde m6A mRNA Modifikasyonu ile Kazanılmış Osimertinib Direnci Arasındaki İlişkinin Araştırılması
TÜBİTAK Projesi
Aztopal N.(Yürütücü), Karakaş Zeybek D.
2018 - 2022
2018 - 2022Pankreatik kanser stromasının hedeflenmesi ile doğal öldürücü hücrelerin sitotoksik aktivitesi arasındaki ilişkinin incelenmesi
TÜBİTAK Projesi
Karakaş Zeybek D. (Yürütücü), Ulukaya E., Pesen Okvur D., Karakaş D.(Yürütücü)
2018 - 2022
2018 - 2022Pankreatik Kanser Hücreleri Ile Nöral Hücreler Arasındaki Eksozomal Mikrorna Aracılı Iletişimin Pankreatik Kanserin Agresif Karakteri Üzerine Etkilerinin Incelenmesi
TÜBİTAK Projesi
Karakaş Zeybek D. (Yürütücü), Aztopal N., Karakaş D.(Yürütücü), Ulukaya E., Özpolat B.
Bilimsel Projelerde Hakemlikler
Ağustos 2024
Ağustos 2024TÜSEB A Grubu Acil AR-GE Projesi
Koç Üniversitesi, Türkiye
Ağustos 2024
Ağustos 2024TÜSEB A Grubu Acil AR-GE Projesi
İstanbul Medeniyet Üniversitesi, Türkiye
Burslar
2016 - 2017
2016 - 20172214A-Yurtdışı Doktora Sırası Araştırma Programı
TÜBİTAK
Atıflar
Toplam Atıf Sayısı (SCOPUS): 616
h-indeksi (SCOPUS): 13
Bilimsel Araştırma / Çalışma Grubu Üyelikleri
2022 - Devam Ediyor
2022 - Devam Ediyor